Theo kế hoạch, trong tháng 12/2026, Bộ Giáo dục và Đào tạo dự kiến ban hành Điều lệ Hội khỏe Phù Đổng toàn quốc năm 2028 và yêu cầu chuyên môn đối với từng môn thi đấu. Đến tháng 3/2027, Ban Chỉ đạo, Ban Tổ chức và bộ phận giúp việc sẽ được thành lập; tháng 6/2027 hoàn thiện bộ nhận diện, biểu tượng. Các địa phương đăng cai hoàn thiện phương án đầu tư, sửa chữa, cải tạo, nâng cấp công trình trong năm 2027.
Hội khỏe Phù Đổng toàn quốc lần thứ XI nhằm phát triển phong trào tập luyện, thi đấu thể thao trong trường học; hình thành thói quen, sự yêu thích luyện tập thể thao thường xuyên của học sinh, hướng tới mục tiêu phát triển thể lực, tầm vóc người Việt Nam. Đây cũng là dịp phát hiện, tuyển chọn, bồi dưỡng học sinh có năng khiếu thể thao, tạo nguồn vận động viên cho thể thao thành tích cao; đồng thời đánh giá thực chất phong trào thể thao học đường để nâng cao chất lượng giáo dục thể chất và hoạt động thể thao trong nhà trường.
Bộ Giáo dục và Đào tạo yêu cầu việc tổ chức phải bảo đảm an toàn, nghiêm túc, công bằng, hiệu quả, tiết kiệm; có phương án bảo đảm an toàn trong thi đấu, đi lại, lưu trú, y tế, phòng ngừa chấn thương và xử lý tình huống khẩn cấp cho học sinh.
Đáng chú ý, các địa phương đăng cai được yêu cầu ưu tiên sử dụng công trình, trang thiết bị hiện có. Việc đầu tư, cải tạo, sửa chữa chỉ thực hiện khi được cấp có thẩm quyền quyết định, bố trí nguồn lực và đáp ứng quy định của pháp luật.
Mỗi Sở Giáo dục và Đào tạo thành lập một đoàn tham dự. Đối tượng tham gia gồm học sinh phổ thông, học sinh trung học nghề và học viên giáo dục thường xuyên đủ điều kiện về độ tuổi, cấp học và hồ sơ theo Điều lệ.
Học sinh là vận động viên đã và đang được đào tạo tại các trung tâm, câu lạc bộ đào tạo vận động viên thuộc các bộ, ngành, địa phương, được hưởng chế độ từ ngân sách nhà nước, tổ chức, doanh nghiệp; học sinh trường phổ thông năng khiếu thể dục thể thao không thuộc đối tượng tham dự.
Học sinh đã đoạt huy chương tại các giải thể thao thuộc hệ thống giải thể thao thành tích cao trong nước và quốc tế hằng năm cũng không được tham dự. Thời gian áp dụng, căn cứ xác định thành tích và các điều kiện cụ thể sẽ được quy định tại Điều lệ Hội khỏe Phù Đổng toàn quốc năm 2028.
Hội khỏe Phù Đổng toàn quốc lần thứ XI được tổ chức theo hai giai đoạn. Giai đoạn 1 diễn ra từ tháng 4-6/2028 tại 5 cụm. Cụm 1 tại Lào Cai gồm Lai Châu, Điện Biên, Sơn La, Lào Cai, Tuyên Quang, Cao Bằng, Lạng Sơn; cụm 2 tại Phú Thọ gồm Thái Nguyên, Phú Thọ, Hà Nội, Bắc Ninh, Hải Phòng, Quảng Ninh, Hưng Yên; cụm 3 tại Quảng Trị gồm Ninh Bình, Thanh Hóa, Nghệ An, Hà Tĩnh, Quảng Trị, Huế, Đà Nẵng; cụm 4 tại Lâm Đồng gồm Quảng Ngãi, Gia Lai, Đắk Lắk, Khánh Hòa, Lâm Đồng, Đồng Nai; cụm 5 tại Vĩnh Long gồm Thành phố Hồ Chí Minh, Tây Ninh, Đồng Tháp, Vĩnh Long, An Giang, Cần Thơ và Cà Mau.
Giai đoạn 1 tổ chức 15 môn thi đấu, gồm: Bơi, Bóng bàn, Bóng chuyền, Bóng đá, Bóng rổ, Cầu lông, Cờ vua, Đá cầu, Đẩy gậy, Điền kinh, Kéo co, Vovinam, Võ cổ truyền, Taekwondo và Thể dục Aerobic, dành cho các cấp học tương ứng.
Giai đoạn 2 được tổ chức tại thành phố Huế từ tháng 7-8/2028, với 10 môn dành cho học sinh trung học phổ thông gồm: Bơi, Bóng bàn, Bóng chuyền, Bóng đá, Bóng rổ, Cầu lông, Đá cầu, Điền kinh, Vovinam và Võ cổ truyền.
Kinh phí chuẩn bị, tổ chức Hội khỏe Phù Đổng được bảo đảm từ ngân sách nhà nước, gồm ngân sách trung ương, ngân sách địa phương, nguồn tài trợ và các nguồn kinh phí hợp pháp khác. Việc quản lý, sử dụng và quyết toán kinh phí phải bảo đảm đúng nhiệm vụ, đúng nguồn, không trùng lặp nội dung chi.
