Lực lượng chức năng đã đưa 2 bệnh nhân về Bệnh viện Phổi Thanh Hóa để cách ly và điều trị; phun khử khuẩn toàn bộ con tàu, khu vực cầu cảng tàu neo đậu cùng các khu vực có liên quan. Đơn vị chức năng điều động tàu ra khu vực neo đậu, hướng dẫn các thuyền viên tự cách ly y tế tại tàu theo quy định và thông báo cho các cơ quan quản lý nhà nước tại cảng biển, doanh nghiệp khai thác cảng phối hợp thực hiện công tác phòng, chống dịch.
Trước đó, lúc 12 giờ ngày 6/9, sau khi biết tin tàu AUVIRGO, với 21 thuyền viên mang quốc tịch Indonesia, chở gần 4.300 tấn dầu ăn từ Singapore sẽ đến khu vực gần cảng Nghi Sơn, cán bộ kiểm dịch y tế tại Thanh Hóa đã ra tàu để thực hiện test nhanh kháng nguyên SARS-CoV-2 cho các thuyền viên và phát hiện 2 trường hợp (bếp trưởng và thủy thủ) dương tính với SARS-CoV-2.
Ngay lập tức cán bộ kiểm dịch y tế đã thực hiện cách ly toàn bộ thuyền viên tại tàu, đồng thời lấy mẫu bệnh phẩm gửi về Trung tâm Kiểm soát bệnh tật Thanh Hóa để xét nghiệm khẳng địnhbằn g phương pháp RT-PCR. Đến 23 giờ ngày 6/9, hai mẫu xét nghiệm cho kết quả dương tính với SARS-CoV-2.