Theo nội dung vụ án, năm 2016, Saigon Co.op đề xuất thương vụ mua lại chuỗi Big C Việt Nam và được UBND Thành phố Hồ Chí Minh chấp thuận chủ trương. Để triển khai, ngày 4/3/2016, bị can Diệp Dũng ký công văn kêu gọi huy động vốn cho thương vụ này. Ngày 10/3/2016, Saigon Co.op nhận được 3.000 tỷ đồng từ các cá nhân, công ty góp vốn để đặt cọc cho thương vụ mua lại Big C. Cuối tháng 5/2016, Saigon Co.op tham gia đấu giá mua lại Big C nhưng không thành công.
Đến khoảng tháng 7/2016, bị can Diệp Dũng đã chỉ đạo bị can Hồ Mỹ Hòa - Giám đốc tài chính Saigon Co.op thực hiện thủ tục lấy 1.000 tỷ đồng từ tài khoản huy động vốn để thực hiện việc hợp tác đầu tư. Ngày 19/8/2016, bị can Diệp Dũng đã không thông qua Hội đồng quản trị tự ý ký Hợp đồng hợp tác đầu tư số 01/2016/HĐHTĐT với Công ty Đai Á số tiền 300 tỷ đồng và Hợp đồng hợp tác đầu tư số 02/2016/HÐHTÐT với Công ty Đô Thị Mới số tiền 700 tỷ đồng với lợi nhuận cố định là 7%/năm.
Theo nội dung hợp đồng hợp tác đầu tư bị can Diệp Dũng ký thì Saigon Co.op được nhận tỷ lệ lợi nhuận cố định trên số tiền hợp tác là 7%/năm; thời hạn hợp đồng là 3 tháng và được thanh toán (gốc + lãi) một lần vào cuối kỳ hợp tác. Vào các ngày 18/11/2016, 30/01/2017, 17/8/2017, 15/11/2017, bị can Diệp Dũng và đại diện 2 công ty trên tiếp tục ký 4 phụ lục hợp đồng để gia hạn thời hạn hợp đồng và giữ nguyên mức lợi nhuận cố định là 7%/năm.
Đến tháng 3/2018, bị can Diệp Dũng đã ký thỏa thuận bổ sung ngày 24/3/2018 với 2 công ty trên để điều chỉnh tỷ lệ lợi nhuận 7%/năm thành 0%/nǎm kể từ ngày 19/8/2016.
Hành vi phạm tội của các bị can gây thiệt hại cho Saigon Co.op hơn 115 tỷ đồng. Hành vi của các bị can đã xâm phạm hoạt động đúng đắn của cơ quan, tổ chức; làm cho cơ quan, tổ chức bị suy yếu, mất uy tín, mất lòng tin của nhân dân vào Nhà nước. Các bị can là người có chức vụ, quyền hạn nhưng vì động cơ cá nhân khác đã vượt quá quyền hạn của mình làm trái công vụ; đồng thời còn có hành vi không thực hiện hoặc thực hiện không đúng nhiệm vụ được giao, gây thiệt hại lớn về tài sản cho Saigon Co.op.
