Theo đó, TP Hồ Chí Minh sẽ có 7 Sở chuyên môn gồm: Sở Tài chính, Sở Nội vụ, Sở Khoa học - Công nghệ, Sở Dân tộc - Tôn giáo, Sở Xây dựng, Sở Giao thông công chánh và Sở Tài nguyên - Môi trường. Thời gian chuyển tiếp từ 1 đến 30 ngày kể từ ngày nghị quyết có hiệu lực để các cơ quan, đơn vị có liên quan tiếp tục thực hiện các chức năng, nhiệm vụ trong giai đoạn cấp có thẩm quyền chưa ban hành quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của cơ quan, đơn vị.
Theo UBND TP Hồ Chí Minh, TP Hồ Chí Minh là đô thị đặc biệt lớn nhất cả nước về dân số và quy mô kinh tế; là trung tâm kinh tế, tài chính, thương mại, văn hóa, khoa học - công nghệ, đổi mới sáng tạo, giáo dục - đào tạo của Vùng kinh tế trọng điểm phía Nam nói riêng và cả nước nói chung; là cửa ngõ quan trọng kết nối khu vực và thế giới. UBND TP Hồ Chí Minh hiện có 21 cơ quan chuyên môn, 8 cơ quan hành chính khác, 35 đơn vị sự nghiệp công lập trực thuộc UBND TP Hồ Chí Minh và 16 UBND quận, 5 UBND huyện, 1 UBND thành phố Thủ Đức.
Để phù hợp với thực tiễn, TP Hồ Chí Minh cần thiết thực hiện sắp xếp tổ chức bộ máy tinh gọn, hoạt động hiệu lực, hiệu quả quản lý của nhà nước; tinh giản biên chế gắn với cơ cấu lại, nâng cao chất lượng, sử dụng hiệu quả đội ngũ cán bộ, công chức, viên chức; điều chỉnh bổ sung, hoàn thiện chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn, trách nhiệm, mối quan hệ công tác của các cơ quan, đơn vị theo hướng tinh gọn.
Theo đó, sau sắp xếp, UBND TP Hồ Chí Minh có 15 cơ quan chuyên môn gồm: Sở Tài chính, Sở Nội vụ, Sở Xây dựng, Sở Giao thông công chánh, Sở Khoa học - Công nghệ, Sở Văn hóa - Thể thao, Sở Du lịch, Sở Dân tộc - Tôn giáo, Sở Tài nguyên - Môi trường, Sở Y tế, Sở Giáo dục - Đào tạo, Sở Tư pháp, Sở Công Thương, Văn phòng UBND TP Hồ Chí Minh, Thanh tra TP Hồ Chí Minh và Sở An toàn thực phẩm (thí điểm theo Nghị quyết 98 của Quốc hội).
Trong đó, Sở Tư pháp chuyển Công an TP Hồ Chí Minh thực hiện một số nhiệm vụ quản lý nhà nước về lý lịch tư pháp và thực hiện dịch vụ công cấp phiếu lý lịch tư pháp từ Sở Tư pháp, tinh gọn, giảm đầu mối tổ chức bên trong.
Tiếp tục duy trì thí điểm Sở An toàn thực phẩm, tinh gọn, giảm đầu mối tổ chức bên trong.
Sở Văn hóa -Thể thao được tổ chức lại trên cơ sở tiếp nhận chức năng quản lý nhà nước về báo chí, xuất bản từ Sở Thông tin và Truyền thông.
Sở Tài chính được tổ chức lại trên cơ sở hợp nhất Sở Kế hoạch - Đầu tư và Sở Tài chính, tiếp nhận Ban Đổi mới quản lý doanh nghiệp Thành phố.
Sở Xây dựng được tổ chức lại trên cơ sở hợp nhất Sở Xây dựng và Sở Quy hoạch và Kiến trúc.
Sở Giao thông công chánh được thành lập trên cơ sở tổ chức lại Sở Giao thông Vận tải và tiếp nhận Văn phòng Thường trực Ban An toàn giao thông; một số chức năng, nhiệm vụ quản lý nhà nước về hạ tầng từ Sở Xây dựng.
Sở Tài nguyên và Môi trường được tổ chức lại trên cơ sở hợp nhất Sở Tài nguyên - Môi trường, Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn.
Văn phòng UBND TP Hồ Chí Minh tiếp nhận chức năng, nhiệm vụ và tổ chức bộ máy của Văn phòng Điều phối Chương trình xây dựng nông thôn mới Thành phố (từ Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn chuyển sang) và Văn phòng Ban Chỉ đạo Chương trình giảm nghèo bền vững Thành phố (từ Sở Lao động Thương binh và Xã hội)
Sở Khoa học - Công nghệ được tổ chức lại trên cơ sở hợp nhất Sở Thông tin Truyền thông và Sở Khoa học công nghệ.
Sở Nội vụ được tổ chức lại trên cơ sở hợp nhất Sở Nội vụ, Sở Lao động Thương binh và Xã hội, tiếp nhận chức năng, nhiệm vụ quản lý nhà nước về lao động, tiền lương, việc làm, người có công, an toàn, vệ sinh lao động, bảo hiểm xã hội, bình đẳng giới từ Sở Lao động Thương binh và Xã hội.
Sở Y tế TP Hồ Chí Minh được tổ chức lại trên cơ sở tiếp nhận lĩnh vực quản lý nhà nước về bảo trợ xã hội, trẻ em; phòng, chống tệ nạn xã hội; quản lý sử dụng Quỹ Bảo trợ trẻ em từ Sở Lao động Thương binh và Xã hội.
Sở Giáo dục - Đào tạo được tổ chức lại trên cơ sở tiếp nhận lĩnh vực quản lý nhà nước về giáo dục nghề nghiệp từ Sở Lao động Thương binh và Xã hội.
Sở Công Thương được tổ chức lại trên cơ sở tiếp nhận Cục Quản lý thị trường Thành phố từ Bộ Công Thương và Trung tâm Tư vấn và Hỗ trợ chuyển dịch cơ cấu kinh tế nông nghiệp từ Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn.
Sở Dân tộc - Tôn giáo được thành lập trên cơ sở sáp nhập Ban Tôn giáo thuộc Sở Nội vụ vào Ban Dân tộc.
Công an TP Hồ Chí Minh tiếp nhận một số chức năng, nhiệm vụ quản lý nhà nước: Quản lý về cai nghiện ma tuý và quản lý sau cai nghiện ma tuý từ Sở Lao động Thương binh và Xã hội; về lý lịch tư pháp và thực hiện dịch vụ công cấp phiếu lý lịch tư pháp từ Sở Tư pháp.
Công an TP Hồ Chí Minh cũng được giao tiếp nhận chức năng quản lý nhà nước về sát hạch, cấp Giấy phép lái xe cơ giới đường bộ từ Sở Giao thông Vận tải; về an toàn, an ninh thông tin mạng từ Sở Thông tin và Truyền thông.
Các đơn vị còn lại như: Sở Du lịch, Thanh tra Thành phố thực hiện tinh gọn giảm đầu mối tổ chức bên trong.
