Theo cơ quan điều tra, quá trình điều hành hoạt động kinh doanh trong 2 năm 2020 và 2021, Nguyễn Ngọc Hưng là người đại diện theo pháp luật, giữ chức Giám đốc Công ty Trách nhiệm hữu hạn sản xuất, thương mại và dịch vụ An Phúc Hưng. Đã có 195 hợp đồng mua bán, các chứng từ đầu vào khống được thiết lập (trên thực tế không có việc mua, bán hàng hóa) với 103 cá nhân ngoài địa bàn tỉnh Hưng Yên với số tiền hàng hóa, nguyên liệu đầu vào hơn 14 tỷ đồng.
Sau đó, Hưng đã sử dụng các hợp đồng mua, bán và chứng từ đầu vào không hợp pháp này để hạch toán hàng hóa, nguyên liệu đầu vào trong hoạt động phát sinh nghĩa vụ thuế làm giảm số tiền thuế thu nhập doanh nghiệp mà Công ty Trách nhiệm hữu hạn sản xuất, thương mại và dịch vụ An Phúc Hưng phải nộp, qua đó đã trốn thuế thu nhập doanh nghiệp gần 2 tỷ đồng.
