Bên cạnh đó, mưa lũ còn làm 15 vị trí bị cây, cột thông tin đổ vào đường sắt; nhiều vị trí nước ngập sâu, chảy xiết gây xói lở nền đá, sạt lở ta luy nền đường, đất đá trôi lấp nền đường, rãnh đường sắt...
Ngoài ra, còn khoảng 15 điểm cây xanh, vật kiến trúc gẫy đổ vào tuyến đường dây thông tin tín hiệu đường sắt; ngập 12 tủ đường ngang có người gác, hư hỏng thiết bị giám sát, khoảng 24 bình ắc quy đã phóng kiệt dung lượng; thiết bị tín hiệu tại ga Yên Bái bị ngập nước, nên một số thiết bị như đài khống chế, máy phát điện và một số thiết bị ngoài trời không kịp tháo dỡ, di dời.
Từ sáng 14/9, ngay sau khi cường độ mưa lũ giảm, các đơn vị đường sắt đã tập trung nhân lực, vật tư, thiết bị, khẩn trương sửa chữa để sớm thông tuyến đường sắt Hà Nội - Lào Cai trong thời gian sớm nhất.
Với các tuyến đường sắt Hà Nội - TP Hồ Chí Minh, Hà Nội - Đồng Đăng, Hà Nội - Hải Phòng, bão số 3 cũng làm đổ nhiều cây, cột điện, cột thông tin vào đường sắt, làm gãy cần chắn, hư hỏng thiết bị giám sát. Các đơn vị đường sắt đã dọn dẹp, khôi phục thiệt hại để chạy tàu...
