Cụ thể, tàu SE1 xuất phát tại ga Hà Nội 22 giờ 15 phút đến Sài Gòn 5 giờ 45 phút, tàu SE2 xuất phát tại ga Sài Gòn 21 giờ 55 phút đến Hà Nội 5 giờ 30 phút.
Theo hành trình, đoàn tàu dừng chủ yếu tại các ga lớn: Huế (10 giờ 54 phút), Đà Nẵng (13 giờ 42 phút) và ngược lại Đà Nẵng (14 giờ 1 phút), Huế (16 giờ 35 phút). Đây là đôi tàu có hành trình nhanh và được ưu tiên nhất trên tuyến đường sắt Bắc - Nam.
Đối với tàu địa phương, trước mắt, tổ chức chạy lại tàu NA1/2 (tuyến Hà Nội - Vinh) và LP5/6 (tuyến Hà Nội - Hải Phòng) với hành trình cụ thể như sau: Tuyến Hà Nội - Hải Phòng, từ ngày 24/4/2020, tổ chức chạy tàu LP5 chạy tại ga Hà Nội 15 giờ 20 phút (chạy tại Long Biên 15 giờ 30 phút thứ 2 - thứ 6); tàu LP6 chạy tại ga Hải Phòng 9 giờ 5 phút. Tuyến Hà Nội - Vinh: Từ ngày 23/4, tàu NA1 chạy tại ga Hà Nội 22 giờ 45 phút; tàu NA2 chạy tại ga Vinh 22 giờ 5 phút. Đặc biệt, hành khách mua vé tàu tuyến Hà Nội - Vinh sẽ được giảm giá từ 10 - 30%.
Trong những ngày tới, căn cứ vào nhu cầu đi lại của hành khách, ngành Đường sắt sẽ tiếp tục tổ chức chạy lại tàu trên các tuyến: Sài Gòn – Nha Trang, Sài Gòn – Phan Thiết, Sài Gòn – Đà Nẵng; Hà Nội – Đồng Hới, Hà Nội – Đà Nẵng, Hà Nội – Yên Bái, Hà Nội – Lào Cai…
