Trong Quyết định số 2268/QĐ-KTNN ban hành Kế hoạch kiểm toán năm 2019 nêu rõ: Kiểm toán nhà nước sẽ thực hiện 59 cuộc kiểm toán thuộc lĩnh vực ngân sách Nhà nước gồm: Kiểm toán báo cáo quyết toán Ngân sách Nhà nước năm 2018 tại Bộ Tài chính, Bộ Kế hoạch và Đầu tư; Kiểm toán việc quản lý, sử dụng tài chính công, tài sản công năm 2018 tại 13 Bộ, ngành; Kiểm toán ngân sách địa phương năm 2018 tại 45 tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương.
Đặc biệt, trong lĩnh vực đầu tư xây dựng và chương trình, dự án, ngoài 1 dự án thuộc khối Quốc phòng, Kiểm toán nhà nước sẽ kiểm toán 42 chương trình, dự án đầu tư, trong đó có nhiều dự án lớn, được dư luận xã hội quan tâm như: Dự án Nhà máy Ethanol Bình Phước; Dự án Nhà máy Đạm Ninh Bình; Dự án đầu tư xây dựng Cảng cửa ngõ quốc tế Hải Phòng; Dự án đầu tư xây dựng Cảng hàng không Quảng Ninh; Dự án Phát triển giao thông đô thị thành phố Hải Phòng; Nhà máy thủy điện Sông Bung 2; Đường dây 500KV Vĩnh Tân - rẽ Sông Mây - Tân Uyên; Nhà máy nhiệt điện Thái Bình 1; Dự án Vệ sinh môi trường TP Hồ Chí Minh - giai đoạn 2...
Kiểm toán nhà nước sẽ thực hiện kiểm toán hoạt động 12 chủ đề, gồm: Kiểm toán hoạt động quản lý, sử dụng ngân sách cấp huyện năm 2018 của 4 quận, huyện, thành phố; 10 chủ đề kiểm toán về các hoạt động, chương trình, dự án đầu tư sử dụng ngân sách nhà nước và 1 cuộc kiểm toán việc triển khai thực hiện Nghị quyết số 42/2017/QH14 về thí điểm xử lý nợ xấu của các tổ chức tín dụng.
Trong lĩnh vực chuyên đề, Kiểm toán nhà nước sẽ thực hiện kiểm toán 30 chuyên đề, trong đó có 4 cuộc kiểm toán chuyên đề phạm vi rộng về các lĩnh vực: Quản lý thu thuế xuất nhập khẩu; Chương trình mục tiêu quốc gia giảm nghèo bền vững giai đoạn 2016-2020; Thực hiện cơ chế tự chủ tài chính đối với các bệnh viện công lập và Thực hiện cơ chế tự chủ tài chính đối với các trường đại học công lập; 26 chuyên đề về các chương trình - dự án thuộc lĩnh vực an sinh - xã hội, phát triển kinh tế vùng; Công tác quản lý, sử dụng đất, tài nguyên khoáng sản, bảo vệ môi trường nhằm đánh giá hiệu quả quản lý vốn Nhà nước, hiệu quả đầu tư trong các Tập đoàn, Tổng công ty, các quỹ đầu tư phát triển ...
Trong lĩnh vực doanh nghiệp và tổ chức tài chính - ngân hàng, ngoài 3 doanh nghiệp thuộc khối Quốc phòng, an ninh, Kiểm toán nhà nước sẽ tiến hành kiểm toán tại 27 đầu mối, gồm: Ngân hàng nhà nước, 21 Tập đoàn, Tổng công ty Nhà nước, 5 ngân hàng và các tổ chức tài chính, tín dụng.
Trong năm 2019, Kiểm toán nhà nước sẽ thực hiện kiểm toán 12 đầu mối thuộc lĩnh vực Quốc phòng, gồm: 9 đầu mối, đơn vị dự toán, 2 doanh nghiệp, 1 dự án đầu tư.
Kiểm toán 8 đầu mối thuộc lĩnh vực an ninh, khối cơ quan Đảng, gồm: Bộ Tư lệnh cảnh sát cơ động; Bộ Tư lệnh cảnh vệ; Cục Cảnh sát Phòng cháy chữa cháy và cứu nạn cứu hộ; 29 công an tỉnh, thành phố; 4 bệnh viện thuộc Bộ Công an; 9 doanh nghiệp thuộc Bộ Công an; Tổng cục dự trữ Quốc gia và 25 tỉnh ủy, thành ủy.
