Theo đó, các đơn vị sự nghiệp công lập trực thuộc Bộ Giao thông vận tải gồm: Viện Khoa học và Công nghệ Giao thông vận tải; Học viện Hàng không Việt Nam; Trường Đại học Hàng hải Việt Nam; Trường Đại học Giao thông vận tải Thành phố Hồ Chí Minh; Trường Đại học Công nghệ Giao thông vận tải; Ban Quản lý dự án đường Hồ Chí Minh; Ban Quản lý dự án Thăng Long… Trường Cao đẳng Giao thông vận tải Trung ương I; II; III; IV; V; VI.
Thủ tướng Chính phủ giao Bộ Giao thông vận tải chủ trì, phối hợp với các bộ, cơ quan có liên quan tiếp tục rà soát, sắp xếp các đơn vị sự nghiệp công lập thuộc Bộ bảo đảm tinh gọn, hoạt động hiệu lực, hiệu quả, phù hợp với quy hoạch mạng lưới đơn vị sự nghiệp công lập thuộc ngành, lĩnh vực và Nghị quyết số 19-NQ/TW ngày 25/10/2017 của Hội nghị lần thứ sáu Ban Chấp hành Trung ương khóa XII "Về tiếp tục đổi mới hệ thống tổ chức và quản lý, nâng cao chất lượng và hiệu quả hoạt động của các đơn vị sự nghiệp công lập".
