Theo đó, bị can Nguyễn Minh Khoa bị khởi tố, bắt tạm giam để điều tra về tội "Đưa hối lộ" theo khoản 4, Điều 364 Bộ luật Hình sự năm 2015. Cùng ngày, Công an tỉnh Sơn La đã công bố quyết định của Bộ trưởng Bộ Công an về việc tước danh hiệu Công an nhân dân với Nguyễn Minh Khoa, nguyên là Thượng tá Công an.
Như vậy, đến nay, 12 người đã bị khởi tố trong vụ án gian lận điểm thi Trung học phổ thông Quốc gia năm 2018 tại Sơn La. Trong đó, 8 bị can bị đề nghị truy tố về tội "Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong thi hành công vụ" theo khoản 2, Điều 356, Bộ luật Hình sự năm 2015, gồm Trần Xuân Yến (nguyên Phó Giám đốc Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Sơn La), Lò Văn Huynh (nguyên Trưởng Phòng Khảo thí và Quản lý chất lượng giáo dục, Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Sơn La), Cầm Thị Bun Sọn (nguyên Phó trưởng Phòng Chính trị tư tưởng, Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Sơn La), Nguyễn Thanh Nhàn (nguyên Phó trưởng Phòng Khảo thí và Quản lý chất lượng giáo dục, Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Sơn La), Nguyễn Thị Hồng Nga (nguyên chuyên viên Phòng Khảo thí và Quản lý chất lượng, Sở Giáo dục và đào tạo tỉnh Sơn La), Đặng Hữu Thủy (nguyên Phó Hiệu trưởng Trường Trung học Phổ thông Tô Hiệu), Đỗ Khắc Hưng (nguyên cán bộ Phòng An ninh chính trị nội bộ, Công an tỉnh Sơn La), Đinh Hải Sơn (nguyên cán bộ Phòng An ninh chính trị nội bộ, Công an tỉnh Sơn La).
Bốn bị can bị đề nghị truy tố về tội "Đưa hối lộ" theo khoản 4, Điều 354 và khoản 4, Điều 364, Bộ luật Hình sự năm 2015, gồm: Hoàng Thị Thành (nguyên Chủ tịch Hội Nông dân huyện Quỳnh Nhai, tỉnh Sơn La), Trần Văn Điện (cán bộ Trường Tiểu học và Trung học Cơ sở Chiềng Cơi, thành phố Sơn La), Lò Thị Trường (lao động tự do, thành phố Sơn La), Nguyễn Minh Khoa (nguyên Phó trưởng Phòng An ninh chính trị nội bộ, Công an tỉnh Sơn La).
Ngoài ra, các bị can Lò Văn Huynh, Nguyễn Thị Hồng Nga, Cầm Thị Bun Sọn bị đề nghị truy tố thêm về tội "Nhận hối lộ" theo khoản 2, Điều 354, Bộ luật Hình sự năm 2015.
Trước đó, trong bản kết luận điều tra bổ sung ngày 5/2/2020 của Cơ quan An ninh điều tra, Công an tỉnh Sơn La đã chỉ ra, tại giai đoạn mới khởi tố đến phiên tòa sơ thẩm, bị can Lò Văn Huynh có khai đã nhận từ ông Nguyễn Minh Khoa (nguyên Phó trưởng Phòng An ninh chính trị nội bộ, Công an tỉnh Sơn La) 1 tỷ đồng để nâng điểm cho hai thí sinh.
Quá trình điều tra bổ sung, bị can Huynh thay đổi lời khai, nói không nhận tiền hoặc thỏa thuận nhận tiền với ông Khoa; 1 tỷ đồng đã nộp nói trên gồm tiền bán đất và tiền tiết kiệm. Cơ quan An ninh điều tra, Công an tỉnh Sơn La, cho rằng Nguyễn Minh Khoa cùng nhiều người khác đã chuyển thông tin thí sinh cho các bị can trong vụ án, tuy nhiên, không đủ căn cứ chứng minh việc tác động cũng như động cơ, mục đích vụ lợi của các trường hợp này nên không quy kết trách nhiệm hình sự.
Liên quan đến vụ án này, ngày 15/10/2019, Tòa án nhân dân tỉnh Sơn La mở phiên tòa xét xử 8 bị cáo về tội “Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong thi hành công vụ”. Tuy nhiên, sau bốn ngày làm việc, Tòa án đã trả hồ sơ vụ án yêu cầu điều tra lại.
