Giải năm nay có 12 đội đăng ký tham dự, thi đấu thành 2 giai đoạn. Giai đoạn I (vòng loại) của Giải Futsal HDBank Vô địch Quốc gia 2020 sẽ diễn ra từ ngày 1- 9/6 tại Nhà thi đấu Trường Đại học Nha Trang, tỉnh Khánh Hòa. 6 đội tham gia là Sanna Khánh Hòa, Tân Hiệp Hưng, Cao Bằng, Quảng Nam, Viet Foodball và Hưng Gia Khang Đăk Lắk. Các đội sẽ thi đấu vòng tròn một lượt để tính điểm, xếp hạng, chọn 4 đội có thứ hạng cao nhất tham dự Giai đoạn II của giải.
Giai đoạn II bao gồm lượt đi và lượt về với 10 đội tham gia, trong đó có 6 đội có thứ hạng từ 1 đến 6 tại giải Futsal HDBank Vô địch Quốc gia 2019: Thái Sơn Nam, Sahako, Sanvinest Sanatech Khánh Hòa, Kadiachain Sài Gòn FC, Đà Nẵng, Thái Sơn Bắc và 04 đội vượt qua Giai đoạn I.
Lượt đi giai đoạn II dự kiến diễn ra từ ngày 14/6 đến ngày 5/7 cũng tại Nhà thi đấu Trường Đại học Nha Trang; lượt về Giai đoạn II từ ngày 5- 26/9 tại Nhà thi đấu Lãnh Binh Thăng, quận 11, Thành phố Hồ Chí Minh.
Tại buổi họp mặt báo chí, ông Nguyễn Ca, Đại diện Ban tổ chức Giải Futsal HDBank Vô địch Quốc gia 2020 cho biết, hiện tại Ban tổ chức đã chuẩn bị đầy đủ các cơ sở vật chất cần thiết ở Nhà thi đấu Trường Đại học Nha Trang, sẵn sàng phục vụ tốt cho giải trong suốt quá trình tại Khánh Hòa.
Trong khuôn khổ của Giải Futsal HDBank Vô địch Quốc gia 2020, tất cả các trận đấu đều miễn phí cho khán giả, tuy nhiên trước tình hình dịch COVID -19 vẫn còn diễn biến phức tạp, Ban tổ chức vẫn thực hiện những biện pháp phòng, chống dịch như: giãn cách chỗ ngồi, khán giả phải đeo khẩu trang khi vào sân xem thi đấu… để đảm bảo tính an toàn cho giải đấu.
Ông Nguyễn Ca cũng cho biết thêm, đội đoạt Cúp vô địch nhận 500 triệu đồng và đại diện Việt Nam tham gia giải Futsal Vô địch các Câu lạc bộ châu Á; đội về Nhì sẽ nhận 200 triệu đồng và đại diện Việt Nam tham dự giải Vô địch các Câu lạc bộ Futsal Đông Nam Á; đội về Ba nhận 100 triệu đồng.
