Theo tài liệu điều tra, từng có thời gian làm tiếp viên hàng không nên năm 2014, sau khi nghỉ không lương, Hoàng Thị Ngọc Anh (sinh năm 1982, trú ở phường Vĩnh Tuy, quận Hai Bà Trưng, Hà Nội), đã kết nối với một đối tượng tên Hà ở Hàn Quốc, bàn bạc mua vàng tại Việt Nam mang sang Hàn Quốc, vận chuyển qua đường hàng không bán kiếm lời.
Thực hiện hành vi phạm tội, Ngọc Anh đã đặt vấn đề với người quen là Phạm Duy Nhuận (sinh năm 1980), nhân viên Công ty TNHH MTV kỹ thuật máy bay VAECO Việt Nam. Theo đó, Nhuận sẽ tìm cách mang vàng lên tàu bay trước cho Ngọc Anh nhằm tránh sự phát hiện của lực lượng chức năng.
Chiều 26/7/2016, Ngọc Anh đến hiệu vàng K.T, trên phố Tôn Đức Thắng, quận Đống Đa, đặt mua 80 “cây” vàng với giá gần 2,9 tỷ đồng. Thanh toán đủ tiền xong, Ngọc Anh đề nghị cửa hàng chế số vàng này thành 4 cục, nhằm mang lên máy bay cho gọn.
Khoảng 21 giờ cùng ngày, Ngọc Anh gặp Nhuận tại sân bay Nội Bài, đưa 4 cục vàng và 2 triệu đồng tiền công, rồi vợ chồng Ngọc Anh sang nhà ga T2 để làm thủ tục xuất cảnh đi Hàn Quốc. Hoàn tất thủ tục xuất cảnh và nhận vé máy bay, Ngọc Anh nhắn tin cho Nhuận số ghế của Sang để Nhuận gắn vàng vào ghế trước khi hai vợ chồng Ngọc Anh lên máy bay.
Hành vi của các đối tượng đã bị cơ quan chức năng phát giác. Khoảng 0 giờ 25 phút ngày 27/7, Phòng Cảnh sát điều tra tội phạm về trật tự quản lý kinh tế và chức vụ (PC46) Công an thành phố Hà Nội phối hợp Chi cục Hải quan Cửa khẩu sân bay quốc tế Nội Bài (Cục Hải quan thành phố Hà Nội), Cảng hàng không Nội Bài tiến hành kiểm tra 2 hành khách Hoàng Thị Ngọc Anh, Nguyễn Ngọc Sang có số ghế 12D và 12G trên chuyến bay VN416, phát hiện thu giữ 4 cục vàng quấn băng dính đen, dính nam châm dưới gầm ghế của Sang.
Tại cơ quan công an, Hoàng Thị Ngọc Anh và Nguyễn Ngọc Sang khai nếu mang trót lọt 80 “cây” vàng trên sang Hàn Quốc bán sẽ được lãi từ 45 triệu đến 60 triệu đồng. Trước đó, tháng 6-2016, với thủ đoạn trên, Ngọc Anh từng mua 20 “cây” vàng, nhờ Nhuận vận chuyển lên tàu bay để mang sang Hàn Quốc bán kiếm lời.
Cơ quan Cảnh sát điều tra đã ra lệnh bắt khẩn cấp đối với Nguyễn Ngọc Sang và Phạm Duy Nhuận về hành vi Buôn lậu. Riêng đối với Ngọc Anh, do đang nuôi con dưới 36 tháng tuổi nên Cơ quan điều tra áp dụng biện pháp ngăn chặn cấm đi khỏi nơi cư trú.
