Thay vào đó, đơn vị tiếp nhận quản lý, thu phí tại cảng tàu quốc tế này là Cảng vụ Đường thủy nội địa Quảng Ninh (thuộc Sở Giao thông Vận tải Quảng Ninh).
Trước đó, ngày 28/7, Cục Hàng hải Việt Nam đã ra Quyết định số 691/QĐ-CHHVN về việc công bố mở bến cảng khách quốc tế Tuần Châu và giao cho Cảng vụ Hàng hải Quảng Ninh (thuộc Cục Hàng hải Việt Nam) quản lý nhà nước chuyên ngành về hàng hải tại khu vực bến cảng nêu trên và được thu các khoản phí theo quy định của pháp luật.
Tuy nhiên, ngày 25/9, Bộ trưởng Bộ Giao thông Vận tải lại ra Quyết định số 3465/QĐ-BGTVT công bố Cảng tàu khách quốc tế Tuần Châu tiếp nhận phương tiện thủy nước ngoài. Theo Quyết định này, thì việc quản lý nhà nước về chuyên ngành và quyền thu phí, lệ phí tại cảng này được giao cho Cảng vụ Đường thủy nội địa Quảng Ninh. Bộ Giao thông cũng giao cho Cục Hàng hải Việt Nam thực hiện bãi bỏ Quyết định số 691 của mình để đảm bảo Quyết định của Bộ trưởng có hiệu lực, đảm bảo công tác quản lý tại cảng tàu được liên tục, thông suốt, an toàn.
Theo chỉ đạo này, ngày 29/9, Cục Hàng hải Việt Nam đã ra Quyết định số 1007/QĐ-CHHVN chính thức bãi bỏ Quyết định số 619 của mình. Như vậy, từ ngày 1/10, quyền quản lý về chuyên ngành, quyền thu phí, lệ phí tại Cảng khách quốc tế Tuần Châu thuộc về về Cảng vụ Đường thủy nội địa Quảng Ninh.
