Đề án này được triển khai trong phạm vi toàn quốc, dành cho các bà mẹ mang thai, trẻ sơ sinh, nhi đồng, thiếu niên, thanh niên đến 18 tuổi. Đề án thực hiện trong 20 năm và chia làm 2 giai đoạn. Trong đó, giai đoạn 1 thực hiện trong 10 năm, thí điểm các giải pháp đồng bộ về dinh dưỡng, thể dục thể thao. Giai đoạn 2 sẽ đánh giá thành quả giai đoạn 1 để thực hiện mở rộng trong phạm vi toàn quốc.
Theo Giám đốc Văn phòng Ban điều phối Đề án 641 Đàm Quốc Chính cho biết: Đề án 641 có phạm vi thực hiện rộng nhưng đến nay mới chỉ triển khai được rất ít hoạt động do còn gặp nhiều khó khăn. Đầu tiên là nhân sự của Ban Điều phối và Ban Chủ nhiệm các chương trình thành phần, cán bộ theo dõi Đề án của các Bộ, ngành có nhiều thay đổi, dẫn đến sự chậm trễ, thiếu thống nhất trong quá trình điều hành và triển khai hoạt động.
Thêm vào đó, nhiều nội dung, nhiệm vụ của các chương trình thành phần đã được phê duyệt nhưng chưa triển khai thực hiện do chưa có kinh phí. Ngoài kinh phí thực hiện các đề tài khoa học và kinh phí duy trì hoạt động của Văn phòng Ban Điều phối, các nguồn kinh phí khác hầu như chưa được triển khai.
Việc huy động nguồn lực xã hội để thực hiện Đề án còn gặp nhiều khó khăn. Giải pháp lồng ghép nguồn vốn của các chương trình, chính sách trên cùng một địa bàn chưa được thực hiện tốt để đảm bảo các nguồn vốn mang lại hiệu quả cao. Không những vậy, việc thiếu tính đồng bộ khi triển khai Đề án giữa trung ương và địa phương cũng là nguyên nhân dẫn đến đề án chưa thực sự hiệu quả.
Theo ông Đàm Quốc Chính, để đảm bảo Đề án thực hiện có hiệu quả và bền vững, việc cần làm là phải hoàn thiện nhân sự Ban Điều phối Đề án từ Trung ương đến các địa phương. Việc này là cần thiết để tạo sự ổn định về nhân sự chủ chốt thực hiện Đề án.