Trung tâm Hành động quốc gia khắc phục hậu quả chất độc hóa học và môi trường có nhiệm vụ chủ trì điều hành, phối hợp, tổ chức triển khai thực hiện các nhiệm vụ khắc phục hậu quả chất độc hóa học đối với môi trường và con người sau chiến tranh; xử lý ô nhiễm hóa chất độc, chất nguy hại, khắc phục sự cố hóa chất độc xạ và môi trường trong phạm vi toàn quốc; chủ trì xây dựng, quản lý cơ sở dữ liệu thông tin về khắc phục hậu quả chất độc hóa học sau chiến tranh.
Đồng thời, thực hiện các hoạt động nghiên cứu khoa học và chuyển giao công nghệ trong lĩnh vực khắc phục hậu quả chất độc hóa học sau chiến tranh, xử lý ô nhiễm hóa chất độc, chất nguy hại, khắc phục sự cố hóa chất độc xạ và môi trường.
Bên cạnh đó, Trung tâm có nhiệm vụ phối hợp xây dựng và tổ chức triển khai các chương trình, kế hoạch công tác về khắc phục hậu quả chất độc hóa học sau chiến tranh, các hoạt động xử lý ô nhiễm hóa chất độc, chất nguy hại, khắc phục sự cố hóa chất độc xạ và môi trường. Trung tâm tổ chức các hoạt động nâng cao năng lực cho các lực lượng tham gia khắc phục hậu quả chất độc hóa học sau chiến tranh, xử lý ô nhiễm hóa chất độc, chất nguy hại, khắc phục sự cố hóa chất độc xạ và môi trường.
Thủ tướng Chính phủ giao Bộ Quốc phòng trực tiếp chỉ đạo Bộ Tư lệnh Hóa học quản lý Trung tâm Hành động quốc gia khắc phục hậu quả chất độc hóa học và môi trường để thực hiện việc điều hành, phối hợp, tổ chức thực hiện các nhiệm vụ khắc phục hậu quả chất độc hóa học sau chiến tranh; xử lý ô nhiễm hóa chất độc, chất nguy hại, khắc phục sự cố hóa chất độc xạ và môi trường trong phạm vi toàn quốc. Bộ trưởng Bộ Quốc phòng chịu trách nhiệm về hoạt động của Trung tâm Hành động quốc gia khắc phục hậu quả chất độc hóa học và môi trường, bảo đảm minh bạch, hiệu quả.
