Tại Cơ quan điều tra, Nguyễn Văn Khẩn khai nhận, do bản tính nóng nảy, muốn giáo dục con nên đã nhiều lần dùng vọt tre, dép, mắc quần áo đánh cháu N.G.B (sinh năm 2018) để lại nhiều thương tích trên cơ thể. Gần đây nhất, ngày 15/5/2023, Khẩn đi làm về không thấy cháu B ở nhà nên đã đi tìm và dùng đoạn tre khô dài khoảng 60 cm đánh cháu nhiều nhát vào phần mông, bắp chân, lưng và tay gây ra nhiều thương tích. Sau khi được phát hiện bị bạo hành, cháu B đã được đưa đi bệnh viện. Hiện cháu đang điều trị tại Bệnh viện Đa khoa Hưng Nhân (huyện Hưng Hà) do đa chấn thương.
Năm 2018, Khẩn sinh sống như vợ chồng với chị Nguyễn Thị Yến (trú tại huyện Quốc Oai, thành phố Hà Nội) nhưng không đăng ký kết hôn và sinh ra cháu N.G.B. Sau đó, chị Yến đã bỏ đi (không rõ đi đâu). Trong khi đó, Giấy khai sinh số 211/2018 do UBND xã Hòa Thạch, huyện Quốc Oai, thành phố Hà Nội cấp không thể hiện bố đẻ của cháu B là ai nên chưa đủ căn cứ pháp lý để xác định bé là con đẻ hay con nuôi hợp pháp của Khẩn.
Hiện Công an huyện Hưng Hà đã thu mẫu ADN của Khẩn với cháu B để giám định gen, xác định quan hệ huyết thống.
Đối tượng Nguyễn Văn Khẩn có hai tiền án về tội “Trộm cắp tài sản” và “Cướp giật tài sản”. Hiện cơ quan Công an đang tiếp tục củng cố hồ sơ và xử lý theo quy định của pháp luật.
