Thông tư nêu rõ, thương nhân có nhu cầu được hưởng thuế ưu đãi VJEPA của Nhật Bản dành cho Việt Nam trong hạn ngạch thuế quan đối với mật ong tự nhiên nhập khẩu vào Nhật Bản theo Hiệp định giữa Việt Nam và Nhật Bản về Đối tác Kinh tế phải nộp hồ sơ tại cơ quan cấp phép (UBND cấp tỉnh) nơi thương nhân xuất khẩu đặt trụ sở chính để được xác nhận.
Căn cứ vào lượng hạn ngạch thuế quan hàng năm Nhật Bản dành cho Việt Nam như quy định tại Phụ lục 2 của Thông tư này và trên cơ sở ngày tiếp nhận đăng ký xin xác nhận, Giấy chứng nhận hạn ngạch thuế quan của thương nhân xuất khẩu được xác nhận theo nguyên tắc thương nhân đăng ký trước được xem xét trước, đăng ký sau được xem xét sau.
Đối với lượng mật ong tự nhiên đăng ký xuất khẩu theo hạn ngạch thuế quan vượt quá lượng hạn ngạch còn lại trong năm đó, UBND cấp tỉnh xem xét xác nhận Giấy chứng nhận hạn ngạch thuế quan theo số lượng hạn ngạch còn lại.
UBND cấp tỉnh thực hiện việc xác nhận Giấy chứng nhận hạn ngạch thuế quan trong vòng ba ngày làm việc kể từ ngày nhận được bộ hồ sơ hợp lệ. Trường hợp không xác nhận, UBND cấp tỉnh có văn bản trả lời nêu rõ lý do.
Thông tư cũng bổ sung quy định về việc trả lại Giấy chứng nhận hạn ngạch trong trường hợp không thực xuất khẩu hoặc hàng bị trả về; quy định rõ trách nhiệm UBND cấp tỉnh trong việc xác nhận lại giấy chứng nhận khi bị rách, mất, hỏng.
Thông tư có hiệu lực từ ngày 3/9/2025.
