Theo đó, Thành phố Hồ Chí Minh mới được thành lập trên cơ sở sáp nhập 3 đơn vị hành chính gồm: tỉnh Bình Dương, tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu và Thành phố Hồ Chí Minh; song hành thực hiện hai nhiệm vụ sắp xếp đơn vị hành chính cấp tỉnh và sắp xếp đơn vị hành chính cấp cơ sở, đảm bảo sau sắp xếp Thành phố Hồ Chí Minh là thành phố trực thuộc Trung ương, tổ chức thực hiện hiệu quả mô hình chính quyền hai cấp; phát huy tiềm năng, lợi thế của 3 địa phương về diện tích đất đai, quy mô dân số và các kết quả tăng trưởng kinh tế.
Sau sắp xếp, Thành phố Hồ Chí Minh mới có 6 tổ chức đảng cấp trên cơ sở gồm: Đảng bộ UBND Thành phố Hồ Chí Minh, Đảng bộ cơ quan Đảng Thành phố, Đảng bộ Công an Thành phố, Đảng bộ Quân sự Thành phố, Đảng bộ Bộ đội Biên phòng Thành phố, Đảng bộ Đại học Quốc gia Thành phố Hồ Chí Minh và 168 đảng bộ cấp xã.
Sau khi sắp xếp, Thành phố phối hợp với Ban Tổ chức Trung ương tham mưu Bộ Chính trị ban hành quyết định thành lập Đảng bộ Thành phố Hồ Chí Minh mới; đồng thời tham mưu chỉ định Ban chấp hành, Ban thường vụ, Bí thư, Phó Bí thư, Ủy viên Ủy ban Kiểm tra, Chủ nhiệm, Phó Chủ nhiệm Ủy ban Kiểm tra cấp ủy nhiệm kỳ 2025 - 2030; thành lập, quy định chức năng, nhiệm vụ, tổ chức bộ máy cơ quan chuyên trách tham mưu, giúp việc cấp ủy Thành phố Hồ Chí Minh; lãnh đạo, chỉ đạo việc kiện toàn tổ chức, cán bộ đảng ủy các cơ quan đảng, Đảng ủy UBND Thành phố, Đảng ủy Quân sự, Đảng ủy Công an, Đảng ủy Bộ đội biên phòng, đảng ủy ở nơi có đặc điểm riêng trực thuộc Thành ủy; lãnh đạo, chỉ đạo việc thành lập, quy định chức năng, nhiệm vụ cơ quan Mặt trận Tổ quốc Việt Nam Thành phố Hồ Chí Minh; chỉ định Ban chấp hành, Ban thường vụ, Bí thư, Phó Bí thư, Ủy viên Ủy ban Kiểm tra, Chủ nhiệm, Phó Chủ nhiệm Ủy ban Kiểm tra Đảng ủy phường, xã nhiệm kỳ 2025 - 2030.
Về tổ chức cơ quan lãnh đạo Mặt trận Tổ quốc, Thường trực Ủy ban Mặt trận Tổ quốc Việt Nam Trung ương hiệp y thống nhất với Thành ủy quyết định thành lập Ủy ban Mặt trận Tổ quốc Việt Nam Thành phố Hồ Chí Minh mới.
Theo đề án, sau sắp xếp, HĐND và các đại biểu HĐND 3 địa phương hợp thành HĐND Thành phố Hồ Chí Minh mới gồm 4 ban như hiện nay. Không bầu các chức danh Chủ tịch, Phó Chủ tịch HĐND, UBND, Trưởng, Phó Đoàn đại biểu Quốc hội, Trưởng các ban HĐND và Ủy viên UBND theo quy định.
Thường trực HĐND Thành phố Hồ Chí Minh chỉ định, bổ nhiệm nhân sự đảm nhiệm các chức danh có liên quan nêu trên. Trường hợp đặc biệt, cho phép chỉ định nhân sự không phải là đại biểu HĐND giữ các chức danh lãnh đạo HĐND cấp tỉnh mới.
Việc tổ chức các cơ quan thuộc HĐND, các cơ quan chuyên môn và tổ chức hành chính khác thuộc UBND Thành phố Hồ Chí Minh mới thực hiện theo Nghị quyết 76 của Ủy ban Thường vụ Quốc hội.
Chính quyền địa phương mới hoàn thành sắp xếp và chính thức đi vào hoạt động chậm nhất là ngày 15/9/2025.
Đại biểu HĐND các xã của Bà Rịa - Vũng Tàu, Bình Dương và Thành phố Hồ Chí Minh hợp thành HĐND cấp xã mới theo số lượng, phương án sắp xếp và tiếp tục hoạt động đến khi hết nhiệm kỳ 2021-2026. HĐND cấp xã có 2 ban là Ban Pháp chế và Ban Kinh tế - Xã hội.
Chính quyền địa phương cấp xã mới hoàn thành sắp xếp và chính thức đi vào hoạt động chậm nhất là ngày 15/8/2025.
Về tổ chức UBND Thành phố Hồ Chí Minh và cấp xã mới, không bầu các chức danh Chủ tịch, Phó Chủ tịch UBND và Ủy viên UBND theo quy định. Thường trực HĐND Thành phố Hồ Chí Minh, cấp xã chỉ định, bổ nhiệm nhân sự đảm nhiệm các chức danh có liên quan nêu trên.
Chính quyền địa phương Thành phố Hồ Chí Minh mới, các xã mới hoàn thành xong việc sắp xếp, chính thức đi vào hoạt động chậm nhất là ngày 15/8/2025 với cấp xã và ngày 15/9/2025 với Thành phố.
Ngoài ra, Thành phố xây dựng đề án sắp xếp thanh tra cấp tỉnh; sắp xếp các đài truyền thanh, truyền hình cấp tỉnh và các cơ quan, báo của Đảng bộ cấp tỉnh đồng bộ với sắp xếp đơn vị hành chính cấp tỉnh.
Tổ chức lại các cơ quan chuyên môn của Thành phố Hồ Chí Minh mới trên cơ sở sắp xếp nguyên trạng các sở và cơ quan hành chính của 3 địa phương. Thành phố còn 15 sở và Sở An toàn thực phẩm thí điểm theo Nghị quyết 98.
Sau sắp xếp, Thành phố Hồ Chí Minh mới có 113 phường, 54 xã và đặc khu Côn Đảo.
