Theo kết luận điều tra, Cơ quan Công an xác định, trong vụ án này, bị can Nguyễn Hữu Tín đóng vai trò là người tổ chức. Các bị can Đào Anh Kiệt (nguyên Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường TP Hồ Chí Minh), Trương Văn Út (Phó trưởng Phòng Quản lý đất thuộc Sở Tài nguyên và Môi trường), Nguyễn Thanh Chương (Trưởng phòng Đô thị thuộc Văn phòng UBND Thành phố), Lê Văn Thanh (Phó Chánh Văn phòng UBND Thành phố) có vai trò giúp sức.
Cụ thể, trong giai đoạn giữ chức Phó Chủ tịch UBND TP Hồ Chí Minh phụ trách lĩnh vực xây dựng, quản lý đất đai, ông Nguyễn Hữu Tín đã ký hàng loạt văn bản, quyết định cho Công ty cổ phần xây dựng Bắc Nam 79 (do Phan Văn Anh Vũ - Vũ “nhôm” làm chủ) thuê khu đất 15 Thi Sách.
Theo kết luận giám định tư pháp của Bộ Tài chính, các văn bản, quyết định ông Tín ký ban hành là trái Quyết định số 09/2007 của Thủ tướng Chính phủ, không phù hợp với quy định tại Luật Đất đai năm 2013. Cơ quan điều tra cũng xác định, bị can Nguyễn Hữu Tín cũng không báo cáo Chủ tịch UBND TP Hồ Chí Minh thời điểm đó là ông Lê Hoàng Quân.
Cũng theo Cơ quan điều tra, trong quá trình điều tra, bị can Nguyễn Hữu Tín thành khẩn thừa nhận hành vi phạm tội và khai rằng, việc ký các văn bản chấp thuận việc giao đất cho Công ty cổ phần xây dựng Bắc Nam 79 vì nhận được công văn của Bộ Công an, bản thân không biết sau khi thuê đất công ty của Phan Văn Anh Vũ không sử dụng đúng mục đích. Cơ quan điều tra cho rằng, trách nhiệm của ông Trần Việt Tân (khi ấy là Thứ trưởng Bộ Công an, người đã ký công văn của gửi cho ông Nguyễn Hữu Tín) đã bị xử lý hình sự với mức án 36 tháng tù tại bản án hình sự phúc thẩm số 346/2019 nên Cơ quan điều tra không xem xét trách nhiệm hình sự của ông Tân trong vụ án này.
Hiện, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đã chuyển hồ sơ sang Viện Kiểm sát nhân dân Tối cao, đề nghị truy tố 5 bị can trên về tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí” theo Điều 219 Bộ luật Hình sự 2015.
