Theo đó, Chủ tịch UBND tỉnh giao Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn chủ trì, phối hợp với các sở, ban, ngành liên quan và UBND huyện Lý Sơn điều tra, khảo sát bổ sung hiện trạng đa dạng sinh học và đề xuất điều chỉnh mở rộng phạm vi, diện tích các phân khu chức năng của Khu bảo tồn biển Lý Sơn cho phù hợp. Các đơn vị phối hợp tổ chức rà soát, đánh giá tác động của dự án có liên quan đến Khu bảo tồn biển, đặc biệt là dự án phát triển du lịch, khu nghỉ dưỡng, khu đô thị lấn biển, dự án nuôi trồng hải sản được cơ quan nhà nước có thẩm quyền phê duyệt hoặc hoạt động không đúng theo quy hoạch từ trước tới nay, tham mưu cấp thẩm quyền xử lý.
Sở Tài nguyên và Môi trường tăng cường công tác quản lý, thanh tra, kiểm tra, xử lý nghiêm tổ chức, cá nhân vi phạm pháp luật về bảo vệ môi trường, đa dạng sinh học biển; nâng cao hiệu quả công tác giao khu vực biển. Bên cạnh đó, Sở kiểm soát nghiêm ngặt hoạt động nhận chìm ở biển, hoạt động lấn biển, hoạt động khai khoáng trên biển ảnh hưởng đến môi trường biển, hệ sinh thái và nguồn lợi thủy sản trong phạm vi Khu bảo tồn biển Lý Sơn.
Sở Kế hoạch và Đầu tư nghiên cứu rà soát, tham mưu UBND tỉnh bố trí vốn đầu tư phát triển cho Khu bảo tồn biển Lý Sơn, phù hợp với khả năng cân đối, bố trí vốn của Trung ương và địa phương.
Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch phối hợp với các sở, ngành liên quan hướng dẫn hoạt động du lịch trong Khu bảo tồn biển Lý Sơn theo quy định.
Công an tỉnh chỉ đạo các phòng, đơn vị trực thuộc tăng cường công tác nắm bắt tình hình tại địa phương, kịp thời phát hiện, điều tra, xử lý nghiêm hành vi vi phạm pháp luật gây ô nhiễm môi trường biển, làm suy giảm đa dạng sinh học biển tại Khu bảo tồn biển Lý Sơn...
Bộ Chỉ huy Bộ đội Biên phòng tỉnh chỉ đạo Đồn Biên phòng Lý Sơn phối hợp với Ban Quản lý Khu bảo tồn biển Lý Sơn tăng cường tuần tra, kiểm soát chặt chẽ tại các phân vùng chức năng Khu bảo tồn biển Lý Sơn; kịp thời phát hiện, bắt giữ, xử lý hành vi vi phạm pháp luật về bảo vệ môi trường, bảo vệ đa dạng sinh học, bảo tồn biển tại vùng biển thuộc Khu bảo tồn biển Lý Sơn.
UBND huyện Lý Sơn chỉ đạo các phòng ban, cơ quan chức năng liên quan phối hợp với Ban Quản lý Khu bảo tồn biển Lý Sơn tổ chức tuyên truyền sâu rộng đến nhân dân chủ trương, chính sách của Đảng, pháp luật Nhà nước về bảo vệ đa dạng sinh học trong Khu bảo tồn biển Lý Sơn. Các đơn vị chức năng tăng cường tuần tra, kiểm soát tại phân khu chức năng Khu bảo tồn biển; chỉ đạo xử lý hành vi vi phạm pháp luật liên quan đến khu bảo tồn biển...
Khu bảo tồn biển Lý Sơn được UBND tỉnh Quảng Ngãi quyết định thành lập vào tháng 2/2017 với tổng diện tích 7.925 ha trong đó, diện tích mặt nước biển là 7.113 ha. Khu bảo tồn được chia làm 3 vùng: Vùng bảo vệ nghiêm ngặt có diện tích 620 ha, vùng phục hồi sinh thái 2.024 ha và vùng phát triển 4.469 ha. Đặc biệt, Khu bảo tồn này nằm trong Quy hoạch hệ thống Khu bảo tồn biển Việt Nam đến năm 2020 đã được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt.
