Đại diện Viện Kiểm sát cho rằng, quá trình điều tra và tại phiên tòa, bị cáo Nguyễn Đức Chung chỉ thừa nhận có mối quan hệ bình thường với Bùi Quang Huy (Tổng Giám đốc Công ty Nhật Cường) chứ không mở đường cho doanh nghiệp này trúng thầu. Tuy nhiên, căn cứ nội dung email Bùi Quang Huy gửi cho ông Chung đề nghị lùi thời gian mở thầu, sau đó ông Chung 3 lần gọi điện cho cấp dưới là cựu Giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư Nguyễn Văn Tứ yêu cầu dừng thầu. Viện Kiểm sát đánh giá, việc này đã tạo điều kiện cho Công ty Nhật Cường trúng hai gói thầu số hóa ở Hà Nội.
"Bởi vậy, Tòa sơ thẩm tuyên ông Nguyễn Đức Chung lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ là không oan và mức án 3 năm cũng phù hợp", đại diện Viện Kiểm sát nhấn mạnh.
Tuy nhiên, Viện kiểm sát ghi nhận tại phiên tòa phúc thẩm, bị cáo Nguyễn Đức Chung và gia đình cung cấp một số tình tiết mà cấp sơ thẩm chưa xem xét. Bị cáo Chung nộp 85 tài liệu là Bằng khen, Giấy khen, Kỷ niệm chương, Huân chương trong thời gian công tác trong ngành Công an và UBND Hà Nội; các Bằng khen, Giấy khen của bố, mẹ đẻ trong các hoạt động chữ thập đỏ, bảo trợ người khuyết tật, trẻ em mồ côi, nạn nhân chất độc màu da cam... Bị cáo Chung còn nộp ba bộ hồ sơ bệnh án thể hiện đang bị bệnh ung thư trực tràng, di căn phổi.
Tại phiên tòa, bị cáo Chung vẫn cho rằng hành vi của mình không đáng bị truy tố và kêu oan. Lời khai tại phiên tòa thể hiện bị cáo thừa nhận toàn bộ hành vi như điện thoại yêu cầu dừng gói thầu, việc Bùi Quang Huy gửi email cho mình… Những nội dung này phù hợp với hồ sơ vụ án, thể hiện sự thành khẩn nên Viện Kiểm sát đề nghị Hội đồng xét xử ghi nhận.
Viện Kiểm sát cho rằng có căn cứ xem xét giảm trách nhiệm hình sự, đề nghị Hội đồng xét xử giảm một phần hình phạt cho bị cáo Nguyễn Đức Chung. Trước đó, tại Tòa cấp sơ thẩm, bị cáo Nguyễn Đức Chung bị tuyên 3 năm tù về tội "Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ".
Cũng trong vụ án này, bị cáo Phạm Thị Thu Hường (cựu Chánh Văn phòng Sở Kế hoạch và Đầu tư) và Phạm Thị Kim Tuyến (cựu Trưởng Phòng Đăng ký kinh doanh, Sở Kế hoạch và Đầu tư) kháng cáo xin giảm hình phạt và đề nghị xem xét về phần dân sự. Hai người lần lượt bị tòa sơ thẩm phạt 3 năm 6 tháng tù và 4 năm 6 tháng tù, cùng về tội "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng".
Viện Kiểm sát cho rằng, hai bị cáo này đã thực hiện chỉ đạo của ông Tứ để lập hồ sơ khống và can thiệp trái pháp luật vào hoạt động đấu thầu khiến kết quả bị sai lệch, gây thiệt hại hơn 26 tỷ đồng cho Nhà nước.
Tuy nhiên tại tòa phúc thẩm, bị cáo Tuyến cùng gia đình đã khắc phục thêm tiền để khắc phục được 2 tỷ đồng, bà Hường 1,8 tỷ đồng (mỗi người bị buộc bồi thường hơn 3 tỷ đồng). Từ đó, Viện Kiểm sát đề nghị Tòa cấp phúc thẩm chấp nhận một phần kháng cáo xin giảm nhẹ hình phạt của hai người này. Về trách nhiệm dân sự, Viện Kiểm sát đề nghị bác toàn bộ kháng cáo.
Sau phần trình bày quan điểm của Viện Kiểm sát, Tòa bước sang phần tranh luận.
