Hội đồng xét xử tuyên phạt chủ mưu của vụ án là bị cáo Mai Thị Hồng Hạnh (cựu Giám đốc kiêm Chủ tịch Hội đồng Thành viên Công ty Xuyên Việt Oil) 11 năm tù về tội “Đưa hối lộ”; 17 năm tù về tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát lãng phí”, tổng hợp hình phạt là 28 năm tù (giảm 2 năm tù so với án sơ thẩm).
Đối với bị cáo Lê Đức Thọ (cựu Bí thư Tỉnh ủy tỉnh Bến Tre), tòa tuyên 14 năm tù giam về tội “Nhận hối lộ"; 7 năm về tội “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn gây ảnh hưởng đối với người khác để trục lợi”. Tổng hợp hình phạt, bị cáo Thọ phải chấp hành là 21 năm tù (giảm 7 năm tù so với án sơ thẩm).
Bị cáo Nguyễn Thị Như Phương (cựu Phó Giám đốc Công ty Xuyên Việt Oil) bị tuyên án 5 năm tù về tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí” (giảm 1 năm so với án sơ thẩm). Các bị cáo Trần Duy Đông (cựu Vụ trưởng Vụ Thị trường trong nước, Bộ Công Thương) và Hoàng Anh Tuấn (cựu Phó Vụ trưởng Vụ Thị trường trong nước, Bộ Công Thương) bị tuyên mỗi bị cáo 5 năm tù cùng về tội “Nhận hối lộ” (giảm 2 năm so với án sơ thẩm). Bị cáo Lê Duy Minh (cựu Cục trưởng Cục Thuế TP Hồ Chí Minh) 4 năm 6 tháng tù về tội “Nhận hối lộ” (giảm 1 năm 6 tháng).
Riêng bị cáo Nguyễn Lộc An (cựu Phó Vụ trưởng Vụ Thị trường trong nước, Bộ Công Thương) bị y án 4 năm tù về tội “Nhận hối lộ”, không được giảm án.
Theo hồ sơ vụ án, bị cáo Mai Thị Hồng Hạnh là người đại diện theo pháp luật, Giám đốc kiêm Chủ tịch Hội đồng Thành viên Công ty Xuyên Việt Oil. Quá trình điều hành hoạt động kinh doanh xăng dầu tại công ty, lợi dụng chức vụ quyền hạn được giao, bị cáo Hạnh đã chỉ đạo cấp dưới, bao gồm bị cáo Nguyễn Thị Như Phương lập 81 báo cáo gian dối về việc sử dụng quỹ bình ổn giá nhằm chiếm đoạt số tiền 219 tỷ đồng.
Ngoài ra, dù Công ty Xuyên Việt Oil đã thu hộ Nhà nước khoản thuế bảo vệ môi trường hơn 1.244 tỷ đồng, Hạnh không thực hiện nghĩa vụ nộp vào ngân sách mà sử dụng cho mục đích riêng và đưa hối lộ cho một số cựu quan chức. Tổng cộng bị cáo Hạnh đã đưa hối lộ 22 lần, với số tiền hơn 31 tỷ đồng cho 8 cá nhân.
Các bị cáo còn lại bị xác định có hành vi nhận hối lộ, lợi dụng chức vụ, quyền hạn để can thiệp, tạo điều kiện cho Công ty Xuyên Việt Oil thực hiện hành vi trái pháp luật; trong đó bị cáo Lê Đức Thọ bị cáo buộc nhận hối lộ hơn 13,8 tỷ đồng.
Hội đồng Xét xử nhận định, tại phiên tòa phúc thẩm, các bị cáo đã thể hiện ý chí khắc phục hậu quả của vụ án khi đã tự nguyện nộp tiền, sử dụng tài sản đang bị kê biên, phong tỏa để khắc phục hậu quả nên có cơ sở để chấp nhận kháng cáo xin giảm nhẹ cho các bị cáo.
Riêng bị cáo Nguyễn Lộc An đã khắc phục thêm 100 triệu đồng, tuy nhiên trong vụ án này, bị cáo An có vai trò tích cực trong việc cấp giấy phép kinh doanh xăng dầu cho Công ty Xuyên Việt Oil, gây hậu quả đặc biệt nghiêm trọng của vụ án. Bị cáo cũng đang bị Tòa án nhân dân thành phố Hà Nội xét xử trong một vụ án khác về tội nhận hối lộ. Hội đồng Xét xử cho rằng, mức hình phạt 4 năm tù mà Tòa án nhân dân TP Hồ Chí Minh tuyên là phù hợp nên không chấp nhận kháng cáo của bị cáo An.
