Nội dung phối hợp theo quy chế, gồm: Xây dựng cơ chế, quy định quản lý; tuyên truyền, quảng bá; quản lý, tu bổ, tôn tạo, bảo vệ giá trị di sản; bảo vệ rừng, đa dạng sinh học, môi trường; quản lý, phát triển du lịch, hoạt động giao thông, đường thủy nội địa, hoạt động thủy sản; phòng, chống dịch bệnh, thiên tai, cháy nổ và tìm kiếm cứu nạn; đảm bảo an ninh trật tự, trật tự an toàn giao thông đường thủy nội địa…
Ban Quản lý Di sản thế giới Vịnh Hạ Long - Yên Tử yêu cầu các sở, ngành, đơn vị, UBND 10 địa phương có liên quan có trách nhiệm phối hợp với Ban Quản lý Di sản thế giới Vịnh Hạ Long - Yên Tử trong công tác quản lý, bảo vệ di sản theo chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn được giao. Các hoạt động phối hợp được các sở, ngành, đơn vị, địa phương thống nhất triển khai thực hiện thường xuyên, kịp thời và hiệu quả, có sự trao đổi thông tin, tạo điều kiện hỗ trợ để các cơ quan, đơn vị thực hiện, hoàn thành tốt các nhiệm vụ.
Di sản thế giới vịnh Hạ Long - quần đảo Cát Bà là di sản liên tỉnh giữa tỉnh Quảng Ninh với Hải Phòng, trong đó vịnh Hạ Long là di sản có địa bàn rộng tiếp giáp với 10 phường, đặc khu trên địa bàn tỉnh Quảng Ninh, có nhiều hoạt động kinh tế - xã hội liên quan đến nhiều ngành, nhiều lĩnh vực.
Việc ký quy chế phối hợp quản lý, bảo vệ, phát huy giá trị di sản nhằm đảm bảo sự thống nhất trong công tác quản lý nhà nước đối với di sản thiên nhiên thế giới vịnh Hạ Long, trọng tâm là bảo vệ các giá trị nổi bật toàn cầu, bảo tồn yếu tố gốc của di sản, bảo vệ cảnh quan môi trường, hệ sinh thái tự nhiên, đa dạng sinh học.
Đồng thời, nâng cao hiệu lực, hiệu quả trong công tác quản lý, bảo vệ, phát huy giá trị di sản; tuân thủ các quy định về bảo vệ di sản theo Công ước quốc tế và theo quy định pháp luật Việt Nam. Qua đó góp phần đảm bảo an ninh - quốc phòng, trật tự an toàn xã hội, ngăn chặn kịp thời và xử lý nghiêm các hành vi vi phạm xâm hại đến vịnh Hạ Long; khắc phục những khó khăn, giải quyết tồn tại, vướng mắc trong công tác quản lý di sản thiên nhiên thế giới vịnh Hạ Long; thúc đẩy phát triển kinh tế - xã hội khu vực, tạo liên kết vùng, không gian du lịch, nâng cao chất lượng, sản phẩm, dịch vụ du lịch.
