Theo đó, căn cứ vào tình hình vận hành khai thác, Công ty cổ phần Tàu cao tốc Phú Quốc (chủ đầu tư) cho biết sẽ ngưng vận hành tuyến TP Hồ Chí Minh - Côn Đảo và ngược lại từ ngày 29/7. Việc ngưng vận hành tuyến được thực hiện cho đến khi có thông báo mới. Nguyên nhân là do tình trạng hoạt động không hiệu quả của tuyến thời gian qua.
Cụ thể, việc khai thác tuyến TP Hồ Chí Minh - Côn Đảo gặp nhiều khó khăn, bất cập làm ảnh hưởng đến sự lựa chọn của hành khách như: Cảng Sài Gòn - Hiệp Phước ở khá xa trung tâm TP Hồ Chí Minh, phải thực hiện trung chuyển hành khách; khách tự di chuyển mất phí vào cảng; vấn đề thời tiết...
Tuyến tàu cao tốc từ TP Hồ Chí Minh đi Côn Đảo khai thác từ giữa tháng 5/2024. Tại TP Hồ Chí Minh, tàu xuất bến tại Cảng Sài Gòn - Hiệp Phước (huyện Nhà Bè), cách trung tâm thành phố hơn 20 km; trong khi tại Côn Đảo tàu khởi hành tại Cảng Bến Đầm.
Doanh nghiệp đã bố trí xe trung chuyển miễn phí từ Công viên 23/9 (Quận 1) ra Cảng Sài Gòn - Hiệp Phước và ngược lại cho khách đăng ký trước. Tuy nhiên, trong thời gian đầu hoạt động đã xảy ra bất cập trong vấn đề trung chuyển. Doanh nghiệp này thông báo tạm dừng hoạt động trung chuyển tại Công viên 23/9 từ đầu tháng 6, nhưng sau đó lại tiếp tục tổ chức trung chuyển cho hành khách.
Tuyến này khai thác với phương tiện vận chuyển là siêu tàu Thăng Long, sức chứa lên tới 1.017 hành khách. Giá vé từ 615.000 đồng – 1,1 triệu đồng/lượt; khai thác 3 chuyến/tuần (cách ngày) xuất phát tại mỗi cảng. Tàu khởi hành lúc 7 giờ sáng từ Cảng Sài Gòn - Hiệp Phước đi Côn Đảo và lúc 13 giờ từ Côn Đảo về TP Hồ Chí Minh tại Cảng Bến Đầm.
