Theo đó, Cơ quan điều tra đề nghị Viện Kiểm sát nhân dân cùng cấp truy tố bị can Nguyễn Minh Quân (cựu Giám đốc Bệnh viện Thủ Đức) về tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”; Phạm Vũ Phong (cựu Giám đốc Công ty Nam Phong) về tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”, “Đưa hối lộ”; Trương Thị Bảo Trân (cựu nhân viên Phòng vật tư trang thiết bị y tế Bệnh viện Thủ Đức) về tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”, “Nhận hối lộ”.
Theo kết luận điều tra, với vai trò là Giám đốc Bệnh viện Thủ Đức, giai đoạn cuối năm 2020 và đầu năm 2021, bị can Nguyễn Minh Quân đã chỉ định cấp dưới hợp thức hóa hồ sơ nhằm thanh toán số lượng bộ sinh phẩm xét nghiệm COVID-19 cho Công ty Việt Á và Công ty Nam Phong cung ứng trước đó. Việc cung ứng bộ sinh phẩm xét nghiệm này không có việc thực hiện xem xét năng lực, kinh nghiệm nhà thầu thực hiện đấu thầu theo quy định. Hành vi phạm tội của Nguyễn Minh Quân đã gây thiệt hại cho Bệnh viện Thủ Đức gần 8 tỷ đồng.
Với vai trò là Giám đốc Công ty Nam Phong, dù Công ty không đủ tính hợp lệ với tư cách pháp nhân của nhà thầu nhưng bị can Phạm Vũ Phong vẫn sử dụng Công ty Nam Phong nhằm thực hiện hành vi thông thầu, gian dối trong đấu thầu liên quan đến Bệnh viện Thủ Đức, gồm: 1 gói thầu chào hàng cạnh tranh, 4 gói chỉ định thầu rút gọn, 33 gói chỉ định thầu mua bộ sinh phẩm xét nghiệm COVID-19 do Công ty Việt Á sản xuất từ Công ty Nam Phong, gây thiệt hại cho bệnh viện. Đồng thời, thông qua Lê Trung Nguyên (nhân viên Công ty Việt Á), Phạm Vũ Phong đã đưa hơn 997 triệu đồng cho nhân viên Bệnh viện Thủ Đức để chi "hoa hồng" cho việc hoàn thiện hồ sơ, để Bệnh viện Thủ Đức thanh toán tiền mua bộ sinh phẩm xét nghiệm COVID-19 cho Công ty Nam Phong.
Cựu nhân viên Phòng vật tư trang thiết bị y tế của Bệnh viện Thủ Đức Trương Thị Bảo Trân là người soạn thảo, hoàn thiện thủ tục chỉ định thầu sai quy định để Bệnh viện thanh toán tiền mua bộ sinh phẩm xét nghiệm COVID-19 gây thiệt hại cho Bệnh viện. Trân là người nhận hơn 997 triệu đồng tiền "hoa hồng" từ Công ty Nam Phong khi thực hiện hoàn thiện hồ sơ để Bệnh viện Thủ Đức thanh toán tiền mua bộ sinh phẩm cho Công ty này.
Các bị can tại Công ty Cổ phần Việt Á có liên quan, là: Vũ Đình Hiệp (cựu Phó Tổng Giám đốc), Lê Trung Nguyên (cựu nhân viên kinh doanh) đã bị Bộ Công đã khởi tố bị can trong vụ án “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng” xảy ra tại Công ty Việt Á, Trung tâm Kiểm soát bệnh tật tỉnh Hải Dương và các cơ quan, đơn vị liên quan. Vì vậy, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an Thành phố Hồ Chí Minh đã tách hành vi và tài liệu liên quan đến Hiệp, Nguyên trong vụ án tại Bệnh viện Thủ Đức chuyển cho Cơ quan điều tra Bộ Công an xử lý chung.
