Căn cứ kết quả điều tra, Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an khởi tố vụ án hình sự "Chiếm đoạt tài liệu bí mật nhà nước" xảy ra tại Hà Nội và các tỉnh, thành phố khác; đồng thời, ra Quyết định khởi tố bị can, Lệnh bắt bị can để tạm giam, Lệnh khám xét chỗ ở đối với ông Nguyễn Văn Yên.
Ông Nguyễn Văn Yên sinh năm 1966, trú tại phường Phú Thượng, quận Tây Hồ, TP Hà Nội; nguyên Phó Trưởng ban Ban Nội chính Trung ương, bị khởi tố để điều tra về tội "Chiếm đoạt tài liệu bí mật Nhà nước", theo quy định tại Điều 337, Bộ luật Hình sự.
Sau khi Viện Kiểm sát nhân dân tối cao phê chuẩn, Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an đã thực hiện tống đạt Quyết định khởi tố bị can, thi hành Lệnh bắt bị can để tạm giam, khám xét chỗ ở đối với bị can Nguyễn Văn Yên.
Hiện, vụ án đang được Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an tiếp tục điều tra, làm rõ để xử lý theo quy định của pháp luật.
