Căn cứ kết quả kiểm tra, xác minh tố giác về tội phạm xác định: Năm 2012, khi đó Đỗ Duy Vinh là Giám đốc Sở Tài chính tỉnh Phú Yên đã tham mưu cho Chủ tịch UBND tỉnh Phạm Đình Cự ký Thông báo số 13/TB-UBND, ngày 07/01/2013 cho phép Công ty Cổ phần Pymepharco chuyển nhượng quyền sử dụng đất đối với thửa đất số 76, tờ bản đồ số 8, thuộc ô phố A2, đường Hùng Vương, thành phố Tuy Hòa.
Điều này là trái với quy định của pháp luật tại khoản 12 Điều 38 Luật Đất đai 2003, khoản 2 Điều 55 Luật Đầu tư 2005 và khoản 3 Điều 2 Quyết định số 1714/QĐ-UBND ngày 18/9/2007 của UBND tỉnh Phú Yên. Việc làm này đã gây thất thoát tài sản Nhà nước với số tiền hơn 10,1 tỷ đồng.
Xác định có dấu hiệu tội phạm “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí” quy định tại khoản 3 Điều 219 Bộ luật Hình sự, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Phú Yên đã khởi tố vụ án hình sự theo quy định của pháp luật.
Ngay sau khi tống đạt quyết định khởi tố vụ án, khởi tố bị can, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Phú Yên đã tiến hành khám xét nơi ở của nguyên Giám đốc Sở Tài chính tỉnh Phú Yên Đỗ Duy Vinh.
