Mặc dù đáp ứng cơ bản cho nhu cầu, nhưng phần lớn khu neo đậu là tự nhiên hoặc được đầu tư xây dựng thì luồng lạch đang bị bồi lấp, khi có bão mạnh hoặc siêu bão sẽ khó đảm bảo an toàn cho tàu cá.
Trước thực trạng này, trong giai đoạn 2016 - 2020, khi xây dựng Trung tâm Nghề cá vùng Nam Trung bộ tại Khánh Hòa, địa phương cùng Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn dành nguồn vốn nâng cấp, xây dựng cảng cá, kết hợp làm nơi tránh trú bão.