Theo Đề án hợp nhất, sẽ thành lập Đảng bộ tỉnh Tây Ninh trực thuộc Trung ương trên cơ sở hợp nhất Đảng bộ tỉnh Tây Ninh và Đảng bộ tỉnh Long An. Nơi đặt trung tâm chính trị - hành chính tại thành phố Tân An. Đảng bộ tỉnh Tây Ninh có 101 tổ chức đảng trực thuộc, gồm: Đảng bộ xã, phường; Đảng bộ các cơ quan Đảng tỉnh; Đảng bộ UBND tỉnh; Đảng bộ Quân sự tỉnh, Đảng bộ Công an tỉnh, Đảng bộ Bộ đội Biên phòng tỉnh. Tổng số đảng viên là 94.306 người.
Về Tổ chức của Mặt trận Tổ quốc và các tổ chức chính trị - xã hội, sau Đại hội Đảng bộ tỉnh Tây Ninh, tỉnh sẽ tổ chức Đại hội đại biểu Mặt trận Tổ quốc Việt Nam tỉnh để hiệp thương cử ra Ủy ban Mặt trận Tổ quốc Việt Nam cấp tỉnh gồm khoảng 90-120 ủy viên, Ban Thường trực Ủy ban Mặt trận Tổ quốc Việt Nam tỉnh gồm 7-9 người. Cơ cấu tổ chức thực hiện theo Đề án của Đảng ủy Mặt trận Tổ quốc Việt Nam, các đoàn thể Trung ương.
Về cơ cấu tổ chức chính quyền địa phương, cơ bản giữ nguyên như mô hình tổ chức chính quyền địa phương cấp tỉnh như hiện nay. UBND tỉnh có 14 cơ quan chuyên môn; 2 tổ chức khác trực thuộc; 11 đơn vị sự nghiệp công lập. Tỉnh có 5 doanh nghiệp 100% vốn Nhà nước và 12 doanh nghiệp có vốn góp của Nhà nước. Các tổ chức hội quần chúng, quỹ xã hội, quỹ từ thiện có phạm vi hoạt động trong tỉnh gồm 24 hội do Đảng và Nhà nước giao nhiệm vụ và 65 hội quần chúng khác.
Tại Hội nghị, Bí thư Tỉnh ủy, Chủ tịch HĐND tỉnh Tây Ninh Nguyễn Mạnh Hùng đề nghị các ban đảng, sở, ngành, các tổ chức chính trị - xã hội tập trung rà soát lại các nội dung còn tồn đọng để giải quyết dứt điểm trước khi hợp nhất hai tỉnh Tây Ninh và Long An; chủ động phối hợp với tỉnh Long An rà soát lại nhân sự lãnh đạo các sở, ngành thuộc diện Ban Thường vụ Tỉnh ủy quản lý cũng như lãnh đạo các phòng trực thuộc đảm bảo tính hài hòa, đáp ứng thực hiện tốt được nhiệm vụ sau hợp nhất; hoàn thành Đề án sắp xếp tổ chức bộ máy, nhân sự của các sở, ngành để thông qua HĐND tỉnh tại kỳ họp sắp tới dự kiến vào cuối tháng 6/2025.
