Hiện tâm bão ước tính ở 20,9 độ vĩ Bắc và 81,6 độ kinh Tây, cách Punta del East, Isla de Juventud, 130 km về phía Đông Nam, cách bãi biển Cajío, tỉnh Artemisa, 215 km về phía Nam-Đông Nam và cách bãi biển Dayaniguas, Pinar del Río 235 km về phía Đông Nam. Trong vài giờ qua, Rafael duy trì hướng đi gần về phía Tây Bắc và tăng nhẹ tốc độ di chuyển lên 22 km/h.
Trong suốt sáng sớm, nhiều trận mưa, mưa rào và giông đã được ghi nhận ở các khu vực miền Đông và miền Trung của Cuba. Dự báo những trận mưa lớn, có lượng mưa từ 100 đến 200 mm sẽ tiếp tục diễn ra trong 24 giờ tới.
Dự báo đầu giờ chiều 6/11 (theo giờ địa phương), bão Rafael sẽ đổ bộ vào đảo Isla de Juventud, sau đó đi thẳng vào đất liền, qua tỉnh Artemisa. Các tỉnh lân cận gồm Pinar del Río, La Habana, Mayabeque và Matanzas cũng sẽ chịu tác động mạnh của bão.
Nhằm ứng phó với cơn bão mạnh này, Chính phủ Cuba đã kích hoạt Hội đồng quốc phòng để chỉ đạo và cập nhật các phương án phòng chống bão, gồm sơ tán người dân, bảo vệ tài sản vật chất (đặc biệt chú trọng đến tàu biển, mái nhà, tháp thông tin liên lạc, bể chứa nước trên mái nhà, v.v.), thu hoạch mùa màng sớm, đảm bảo lương thực cho người dân và chuẩn bị máy phát điện ở những khu vực dễ bị tổn thương nhất.
Bên cạnh đó, Chính phủ Cuba đã tạm đóng cửa trường học các cấp, tạm dừng các hoạt động phi thiết yếu ở các địa phương nơi bão có thể đi qua.
Rafael là cơn bão mạnh thứ 2 trong vòng 3 tuần qua đổ bộ vào Cuba, sau bão Óscar. Cơ quan Phòng vệ dân sự Cuba xác nhận bão Oscar đổ bộ vào miền Tây nước này đã khiến ít nhất 7 người đã thiệt mạng, hàng nghìn người phải sơ tán, hơn 1.000 ngôi nhà bị hư hại, gây nhiều thiệt hại về cơ sở hạ tầng khác.
