Nếu như ở SEA Games 28 tại Singapore, môn bóng đá nữ không được tổ chức, thì đến SEA Games 29, dù bóng đá nữ được tổ chức nhưng không cho phép truyền hình trực tiếp. Ngoài Việt Nam, đại diện lãnh đạo nhiều đoàn thể thao tham dự SEA Games đã chất vấn nước chủ nhà về vấn đề này, tuy nhiên mọi việc đã bị Ban tổ chức nước chủ nhà lờ đi. Ngoài bóng đá nữ, môn thi đấu bóng chuyền nam và nữ tại SEA Games 29 cũng không được nước chủ nhà sản xuất tín hiệu truyền hình trực tiếp.
 Bất chấp những nỗ lực đàm phán, VTV cũng không thể phát sóng môn bóng đá nữ. |
Trước tình hình trên, VTV tự tổ chức ghi hình và phát sóng trực tiếp các trận đấu của bóng đá nữ cũng như môn bóng chuyền nam và nữ được VTV ghi hình và phát trực tiếp để phục vụ người hâm mộ thể thao nước nhà.
Do môn bóng đá nữ chỉ có 5 đội tuyển góp mặt (gồm Việt Nam, Thái Lan, Philippines, Myanmar và chủ nhà Malaysia) nên thi đấu theo thể thức đấu vòng tròn một lượt tính điểm. Đội xếp nhất sẽ nhận Huy chương vàng. Các đội xếp nhì và ba sau 4 lượt đấu lần lượt nhận Huy chương bạc, Huy chương đồng. Kỳ SEA Games 2009 tại Lào là lần gần nhất thể thao Việt Nam vô địch bóng đá nữ.
SEA Games 2009 có 5 đội tuyển dự nội dung bóng đá nữ và thi đấu vòng tròn nhưng có tới 4 đội vào bán kết và hai đội thắng ở bán kết sẽ giành quyền vào chung kết. Tại trận chung kết, sau 120 phút không phân biệt thắng thua, đội tuyển nữ Việt Nam đã vượt qua Thái Lan sau loạt đá 11m, giành Huy chương vàng.
SEA Games 29 là đại hội đầu tiên mà ban tổ chức tổ chức xét nghiệm doping bất kỳ với các vận động viên tham dự. Theo ông Trần Đức Phấn, Trưởng đoàn thể thao Việt Nam tại SEA Games 29, thực hiện yêu cầu này, từ hai tháng trước đến ngày khai mạc SEA Games 29 diễn ra, các vận động viên của đoàn thể thao Việt Nam tập trung ở các trung tâm huấn luyện thể thao quốc gia bị “cấm trại” hoàn hoàn.
Mọi sinh hoạt của vận động viên từ tập luyện, ăn uống, điều trị chấn thương... đều diễn ra tại các trung tâm huấn luyện. Các vận động viên được khuyến cáo không ăn uống bên ngoài và ngay cả thịt lợn phục vụ bữa ăn cho các vận động viên cũng được kiểm tra kỹ chất tạo nạc phòng khi nằm trong danh mục chất cấm. Cũng theo ông Trần Đức Phấn, theo yêu cầu của Tổ chức Phòng chống doping thế giới, tại SEA Games 29, đoàn thể thao Việt Nam phải kiểm tra doping cho 30 vận động viên và tất cả kết quả xét nghiệm đều được công bố.
