Phản ứng về cáo buộc trên, Ấn Độ gọi cuộc điều tra là "vô căn cứ" và nói rằng chính Canada đã can thiệp vào công việc nội bộ của họ.
Các tài liệu của CSIS cáo buộc rằng vào năm 2021, Chính phủ Ấn Độ đã nhắm mục tiêu vào các khu vực bầu cử cụ thể được cho là có các cử tri gốc Ấn Độ đồng tình với phong trào Khalistan, hoặc quan điểm ủng hộ Pakistan. CSIS cáo buộc rằng một cơ quan được chính phủ ủy quyền có thể đã cố gắng tác động đến các quy trình dân chủ thông qua hỗ trợ tài chính bất hợp pháp cho các ứng cử viên được ưu ái.
Tương tự, vào năm 2019, các quan chức của Chính phủ Pakistan đã cố tình tham gia vào các hoạt động bí mật nhằm thúc đẩy lợi ích của Pakistan trong bối cảnh chính trị của Canada. Mặc dù Ấn Độ bác bỏ các cáo buộc và đảm bảo cam kết không can thiệp vào tiến trình dân chủ của các quốc gia khác, song cuộc điều tra của Canada về sự can thiệp của nước ngoài đã làm gia tăng căng thẳng trong mối quan hệ vốn đã căng thẳng giữa hai nước.
Những cáo buộc trước đây của Thủ tướng Canada Justin Trudeau về sự liên quan của Ấn Độ trong vụ sát hại phần tử khủng bố Hardeep Singh Nijjar của phong trao ly khai Khalistan trên đất Canada đã trở thành điểm nóng trong quan hệ song phương giữa hai nước. Bất chấp việc Ấn Độ bác bỏ những cáo buộc này, vấn đề đã dẫn đến những hậu quả về mặt ngoại giao, bao gồm cả việc tạm dừng cấp thị thực cho người Canada và giảm sự hiện diện ngoại giao.
