Theo đó, bên cạnh 8 bãi đỗ xe có sẵn trong quy hoạch, Trung tâm chính trị Ba Đình được xem xét bổ sung 2 bãi xe ngầm nằm dưới các khu vực công viên cây xanh tại phía đông bắc Công viên Bách Thảo và khu vực vườn hoa giáp tượng đài Lê Nin. Sở Giao thông Vận tải khẳng định 2 bãi đỗ xe ngầm này phù hợp với nguyên tắc trong đồ án và chủ trương của UBND Hà Nội, chỉ đạo của Thủ tướng.
Lãnh đạo Sở Giao thông Vận tải Hà Nội lưu ý việc xác định quy mô diện tích, công suất đối với 2 bãi đỗ xe ngầm này cần có ý kiến của Ban quản lý Lăng Chủ tịch Hồ Chí Minh dựa trên nhu cầu thực tế còn thiếu (số lượng chỗ đỗ xe) làm cơ sở tính toán quy mô, diện tích.
Bên cạnh đó, phương án nghiên cứu bố trí bãi đỗ xe phải bảo đảm an ninh quốc phòng trong khu vực Trung tâm chính trị, không làm thay đổi chức năng cơ bản của khu đất là chức năng cây xanh, tại phía đông bắc Công viên Bách Thảo cần dành một phần diện tích cho các ô tô khách cỡ lớn đáp ứng nhu cầu tham quan.
Theo Phó giám đốc Sở Giao thông Vận tải Hà Nội Nguyễn Xuân Thanh, qua rà soát đồ án quy hoạch bến xe, bãi đỗ xe, trung tâm tiếp vận và trạm dừng nghỉ đã được HĐND thành phố Hà Nội phê duyệt, khu vực trung tâm chính trị Ba Đình có 8 bãi đỗ xe ngầm gồm: Khuôn viên Bảo tàng Hồ Chí Minh có hai bãi xe ngầm (diện tích đất 6.300 m2), khu vực vườn Kính Thiên (7.000 m2), phía Tây Công viên Bách Thảo có hai bãi xe ngầm (2.500 m2), phía Bắc đường Thụy Khuê có 2 bãi xe ngầm (với tổng cộng 7.000 m2), khu tập thể Bảo tàng Hồ Chí Minh (6.000 m2).
