Tại Cơ quan điều tra, Nguyễn Thanh Quân đã thừa nhận hành vi phạm tội của mình. Qua điều tra ban đầu, xác định Nguyễn Thanh Quân đã có quan hệ nam nữ với nữ sinh khi còn học lớp 9 tại trường nơi ông này giảng dạy.
Theo hồ sơ vụ việc, ngày 18/11, em H. (học sinh lớp 10 tại huyện Vĩnh Thuận) hẹn gặp ông Quân (đã có vợ, con) tại nhà trọ tại khu phố Vĩnh Phước 2, thị trấn Vĩnh Thuận. Tại đây, H. cho rằng ông Quân hứa sẽ ly hôn với vợ để cưới H. làm vợ nhưng không thực hiện nên quyết định uống thuốc tự tử. Nữ sinh được ông Quân và chủ nhà trọ chở đi cấp cứu kịp thời nên không ảnh hưởng tính mạng.
Nhận được thông tin, Ban Giám hiệu Trường Trung học cơ sở Vĩnh Phong 2 đã yêu cầu ông Quân làm tường trình. Ông Quân đã thừa nhận mọi hành vi sai trái của mình. Ngày 28/11, Chi bộ nhà trường họp kiểm điểm, dưới sự chỉ đạo của Đảng ủy xã Vĩnh Phong và Ủy ban Kiểm tra Huyện ủy, đề xuất hướng xử lý. Theo đó, Chi bộ bỏ phiếu kín biểu quyết hình thức kỷ luật đối với ông Quân là khai trừ khỏi Đảng.
