Do thói quen chăn nuôi nhỏ lẻ của người dân tại khu dân cư nên đã không qua xử lý chất thải rắn, nước thải chăn nuôi dẫn đến tình trạng ô nhiễm môi trường đất, nước, không khí làm ảnh hưởng đến sức khỏe, đời sống của người dân sinh sống xung quanh khu vực. Tuy nhiên, giải quyết vấn nạn ô nhiễm môi trường nông thôn này vẫn chưa được chính quyền địa phương xử lý triệt để.
Trước diễn biến phức tạp của bệnh viêm da nổi cục trên trâu, bò xảy ra trên địa bàn tỉnh, Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn tỉnh Tây Ninh vừa có văn bản chỉ đạo Chi cục Chăn nuôi và Thú y phối hợp với các huyện, thị xã, thành phố trong tỉnh tập trung triển khai các giải pháp kiểm soát, khống chế dịch bệnh, nhất là tập trung điều trị, tiêm vaccine phòng bệnh, tiêu độc sát trùng chuồng trại, môi trường; không để dây dưa kéo dài, gây thiệt hại kinh tế cho người chăn nuôi.
Sau một thời gian tạm lắng, hiện nay trên địa bàn tỉnh Bình Phước đã phát hiện 3 ổ dịch tả lợn châu Phi tại các hộ chăn nuôi nhỏ lẻ. Chính quyền và cơ quan thú y địa phương đang triển khai các biện pháp khống chế dập dịch, ngăn chặn dịch bệnh lây lan.
Theo Quy chuẩn kỹ thuật quốc gia về nước thải chăn nuôi, các hộ chăn nuôi nhỏ không phải thực hiện thủ tục đánh giá, lập kế hoạch bảo vệ môi trường. Vậy nên, việc kiểm soát môi trường hàng ngàn hộ chăn nuôi nhỏ lẻ ở Đồng Nai gần như bị bỏ ngỏ.