Đồng thời, Việt Kiểm sát yêu cầu Cơ quan Cảnh sát điều tra, Công an thành phố Hà Nội, tiến hành điều tra theo quy định của Bộ luật Tố tụng Hình sự.
Trước đó, trong công văn số 141/CSĐT-PC01 ngày 22/3/2019 gửi Viện Kiểm sát nhân dân thành phố Hà Nội, Cơ quan Cảnh sát điều tra, Công an thành phố Hà Nội, nêu rõ: Thực hiện Công văn số 27/VKS-P2 ngày 19/3/2019 của Viện Kiểm sát nhân dân thành phố Hà Nội về việc yêu cầu thay đổi Quyết định khởi tố vụ án, Quyết định khởi tố bị can đối với Nguyễn Trọng Trình từ tội “Dâm ô người dưới 16 tuổi” sang tội danh “Hiếp dâm người dưới 16 tuổi”; căn cứ Điều 36, Điều 39, Điều 180 – Bộ luật Tố tụng Hình sự năm 2015, Cơ quan Cảnh sát điều tra, Công an thành phố Hà Nội, đã ra Quyết định thay đổi Quyết định khởi tố bị can số 09 ngày 22/3/2019 đối với bị can Nguyễn Trọng Trình từ tội “Dâm ô người dưới 16 tuổi” sang tội danh “Hiếp dâm người dưới 16 tuổi” theo quy định tại Điều 142, khoản 3 – Bộ luật Hình sự năm 2015. Đồng thời, Cơ quan Cảnh sát điều tra đề nghị Viện Kiểm sát nhân dân thành phố Hà Nội phê chuẩn Quyết định này.
Theo điều tra ban đầu, chiều 24/2, Công an huyện Chương Mỹ tiếp nhận tin báo của gia đình cháu Vũ Như Q. (sinh năm 2009, trú ở huyện Chương Mỹ) về việc trưa cùng ngày, cháu Q. trên đường đi học về đã bị một đối tượng nam giới điều khiển xe máy đón đi và xâm hại tình dục. Qua điều tra, cơ quan Công an xác định và triệu tập nghi can Nguyễn Trọng Trình đến làm việc. Bước đầu, đối tượng Trình đã khai nhận hành vi phạm tội.
Cơ quan điều tra đã trưng cầu giám định để xác định tổn thương đối với nạn nhân. Kết quả sơ bộ cho thấy cháu bé bị gãy 1 chiếc răng, gãy đầu dưới xương quay phải, bị một số vết tụ máu, xây xát da nông ở vùng mặt, cổ, ngực và bị tổn thương bộ phận sinh dục.