Trước đó, qua công tác nắm tình hình địa bàn, Phòng Cảnh sát điều tra tội phạm về tham nhũng, kinh tế, buôn lậu - Công an tỉnh Quảng Bình nhận thấy Công ty Trách nhiệm hữu hạn thương mại xây dựng và vận tải Thiên Ân do Ngô Văn Xoài làm Giám đốc có dấu hiệu trốn thuế nên đã lập án đấu tranh.
Qua điều tra, lực lượng chức năng phát hiện quá trình hoạt động kinh doanh của Công ty Thiên Ân từ năm 2015 đến 2017, với cương vị là Giám đốc công ty, Ngô Văn Xoài đã có hành vi chỉ đạo công nhân, kế toán công ty và cá nhân trực tiếp dùng các mối quan hệ để xin 519 tờ hóa đơn giá trị gia tăng khống (hóa đơn không kèm theo hàng hóa, dịch vụ) của các công ty khác, với tổng giá trị thanh toán hơn 10 tỷ đồng.
Bằng thủ đoạn trên, Ngô Văn Xoài đã thực hiện hạch toán hàng hóa, nguyên liệu đầu vào trong hoạt động phát sinh nghĩa vụ thuế nhằm mục đích làm giảm số tiền thuế giá trị gia tăng và thuế thu nhập doanh nghiệp phải nộp là hơn 2,7 tỷ đồng. Trong đó, thuế giá trị gia tăng gần 900 triệu đồng và thuế thu nhập doanh nghiệp hơn 1,8 tỷ đồng.
Sau khi tống đạt các quyết định tố tụng, lực lượng chức năng đã tiến hành khám xét chỗ ở, nơi làm việc của Ngô Văn Xoài để tiếp tục điều tra, mở rộng vụ án.