Theo thông tin ban đầu, ông Sử bị bắt tạm giam do có liên quan đến sai phạm của cấp dưới là Đặng Phi Long, đăng kiểm viên của Trung tâm đăng kiểm 68.01S. Long là người trực tiếp thẩm định hồ sơ đăng kiểm xe cơ giới đường bộ đối với xe cải tạo có thiết kế và miễn thiết kế. Trước đó, vào ngày 8/11/2023, Long đã bị Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Kiên Giang bắt tạm giam cùng với 2 người khác về tội "Giả mạo trong công tác".
Quá trình điều tra mở rộng vụ án, đến nay, xác định Nguyễn Quốc Sử lạm dụng chức vụ, quyền hạn được giao, có hành vi nhận hối lộ số tiền 28.500.000 đồng để chỉ đạo cấp dưới làm khống 32 hồ sơ nghiệm thu sau cải tạo, cấp 32 giấy chứng nhận an toàn kỹ thuật và bảo vệ môi trường, thống nhất cho kiểm định 32 phương tiện ô tô tập lái có lắp đặt phanh phụ phục vụ giảng dạy đào tạo sát hạch lái xe trái quy định của pháp luật.