Vào lúc 8 giờ 5 phút ngày 17/11, tàu khách mang số hiệu SE3 đang hành trình theo hướng Bắc - Nam khi đến km 541+500 thuộc khu gian Long Đại - Mỹ Đức (địa bàn giáp ranh giữa xã Xuân Ninh và An Ninh, huyện Quảng Ninh, tỉnh Quảng Bình) đã va chạm với xe máy mang biển kiểm soát 73V1-9843.
Xe máy do anh Nguyễn Văn N (sinh năm 1967, trú tại xã Bảo Ninh, thành phố Đồng Hới) điều khiển đang qua điểm giao nhau giữa đường sắt và đường bộ. Cú va chạm mạnh đã hất anh N ra xa hơn 20m và khiến anh tử vong tại chỗ, chiếc xe máy bị biến dạng, hư hỏng hoàn toàn...
Sau khi vụ tai nạn xảy ra, Công an huyện Quảng Ninh và các lực lượng chức năng đã có mặt kịp thời để phối hợp giải quyết vụ việc. Tàu khách SE3 bị chậm hành trình gần 30 phút.
Điểm xảy ra vụ tai nạn là đường ngang dân sinh giao với đường sắt chỉ có biển báo, không có rào chắn và đèn tín hiệu. Được biết, trên địa bàn huyện Quảng Ninh có nhiều tuyến đường ngang dân sinh giao nhau với đường sắt. Điều đáng nói nhiều điểm giao nhau chỉ có biển báo nhưng không có rào chắn hoặc đèn tín hiệu cảnh báo nên thường hay xảy ra tai nạn giao thông.