Căn cứ kết quả điều tra khảo sát, Sở Tài nguyên và Môi trường Bắc Ninh đề xuất danh mục nguồn nước cần lập hành lang bảo vệ bao gồm 10 sông và 20 ao, hồ trên địa bàn thành phố Bắc Ninh và thị xã Từ Sơn.
Năm 2016 sở Tài nguyên và Môi trường phối hợp với các huyện, thị xã thành phố đã cắm mốc bảo vệ nguồn nước cho 3 sông là: Sông Đuống, sông Cầu và sông Thái Bình với tổng số 168 mốc.
Việc cắm mốc góp phần bảo vệ sự ổn định của bờ và phòng, chống lấn chiếm đất ven nguồn nước. Tạo không gian cho các hoạt động văn hóa, thể thao, vui chơi, giải trí, bảo tồn và phát triển các giá trị về lịch sử, văn hóa, tín ngưỡng liên quan đến nguồn nước. Phòng, chống các hoạt động có nguy cơ gây ô nhiễm, suy thoái nguồn nước.
Bên cạnh đó, Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Bắc Ninh cũng triển khai kế hoạch thực hiện dự án điều tra đánh giá hiện trạng và giải pháp quản lý, sử dụng ao hồ, đầm trên địa bàn.
Trong đó, Chủ tịch UBND tỉnh Bắc Ninh yêu cầu UBND cấp huyện niêm yết công khai tại UBND xã, phường, thị trấn nơi có nguồn nước phải lập hành lang bảo vệ, đồng thời thông báo trên các phương tiện thông tin đại chúng để nhân dân được biết.