Người phát ngôn Bộ Chỉ huy Tây Mindanao, Thiếu tá Filemon Tan cho biết các đơn vị quân đội đã được lệnh báo động tìm kiếm các nạn nhân mất tích, trong đó có thuyền trưởng của tàu. Theo Thiếu tá Tan, chiếc tàu này liên lạc lần cuối cùng qua sóng radio với một chiếc tàu vào lúc 3 giờ sáng 20/12. Khi tiếp cận vị trí tín hiệu của chiếc tàu cá trên vào khoảng 5 giờ sáng, các thủy thủ trên tàu được liên lạc phát hiện toàn bộ thuyền viên của tàu đã mất tích, thiết bị định vị VHF Radio/GPS đã bị đánh cắp.
Hiện lực lượng đặc nhiệm chung Sulu của quân đội đang riển khai các lực lượng để tiến hành tìm kiếm các thuyền viên bị mất tích. Theo Thiếu tá Tan, có thể các thuyền viên đã bị bắt cóc. Giới chức Philippines chưa thể xác nhận nhóm phiến quân Hồi giáo Abu Sayyaf có đứng sau vụ việc trên hay không.
Nhóm phiến quân Hồi giáo Abu Sayyaf thành lập trong thập kỷ 90 của thế kỷ trước, hiện gồm khoảng 400 tay súng hoạt động ở miền Nam Philippines, khét tiếng với những vụ bắt cóc tống tiền, đánh bom và hành quyết con tin. hiện nhóm này vẫn đang giữ khoảng 20 con tin nước ngoài và Philippines ở Sulu. Tổng thống Philippines Rodrigo Duterte đã chỉ thị quân đội truy lùng các tay súng Abu Sayyaf và tuyên bố không có kế hoạch thúc đẩy thỏa thuận hòa bình với nhóm này.