Sông Kỳ Lộ chảy qua địa bàn huyện Đồng Xuân (Phú Yên) có chiều dài hơn 100km. Hiện nay, nhiều đoạn lòng sông đã bị bồi lấp, dòng chảy liên tục bị thay đổi, gây xói lở diện tích đất sản xuất và khó tiêu úng, thoát lũ trong mùa mưa, bão.
Ngày 30/11, dự báo, nước lũ trên sông Ba và sông Kỳ Lộ sẽ vượt mức báo động 3 trong 24 giờ tới. Do vậy, UBND tỉnh Phú Yên chỉ đạo các địa phương khẩn trương di dời người dân sống ở khu vực trũng thấp đến nơi an toàn.
Mưa lớn kéo dài khiến nước lũ từ thượng nguồn sông Kỳ Lộ đổ về đầm Ô Loan nhiều, nhưng cửa biển An Hải, xã An Hòa Hải, huyện Tuy An, tỉnh Phú Yên, đã bị bồi lấp, nước lũ không thể thoát ra biển mà đổ trực tiếp về vùng nuôi hải sản Lễ Thịnh, thôn Phú Lương, xã An Ninh Đông.
Từ đợt lũ tháng 10/2020 đến nay, gần 8ha đất sản xuất nông nghiệp của hơn chục hộ dân ở thôn Phú Sơn, xã Xuân Quang 2, huyện Đồng Xuân, tỉnh Phú Yên bị cát từ sông Kỳ Lộ bồi lấp. Do lượng cát bồi lấp lớn, người dân hiện không thể tái tạo sản xuất và gặp nhiều khó khăn.
Từ chiều 23/11 đến sáng 24/11, mưa liên tục kết hợp với nước từ thượng nguồn đổ về đã gây ngập lụt vùng hạ du sông Kỳ Lộ thuộc địa bàn huyện miền núi Đồng Xuân và huyện Tuy An, tỉnh Phú Yên.
Sáng 31/1, tại thị trấn La Hai, (huyện miền núi Đồng Xuân), tỉnh Phú Yên đã diễn ra lễ thông tuyến dự án Tuyến thoát lũ, cứu nạn vượt sông Kỳ Lộ, chấm dứt thực trạng chia cắt giao thông giữa miền núi với đồng bằng tại đây khi có mưa lũ lớn.