Đồng thời, đơn vị phối hợp với Viện Kiểm sát nhân dân cùng cấp tiến hành khám xét nơi ở và nơi làm việc của Nguyễn Lê Ninh để thu thập tài liệu có liên quan đến vụ án.
Theo điều tra ban đầu, trong quá trình công tác tại Văn phòng Đăng ký đất đai tỉnh Quảng Ngãi - Chi nhánh thị xã Đức Phổ, Nguyễn Lê Ninh đã thỏa thuận với người dân hoặc qua đối tượng môi giới (cò đất) nhận làm hồ sơ cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất đối với thửa đất chưa được cấp giấy chứng nhận lần đầu. Ninh còn lợi dụng chức vụ, quyền hạn của mình để lấy phôi giấy chứng nhận đã cấp cho hộ gia đình, cá nhân khác để làm sai lệch, thay đổi thông tin và lập khống hồ sơ để làm thủ tục cấp đổi Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất. Văn phòng Đăng ký đất đai tỉnh Quảng Ngãi đã triển khai thu hồi các Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất do Ninh thực hiện không đúng quy định.
Vụ án đang được Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an thị xã Đức Phổ tiếp tục điều tra và xử lý theo quy định của pháp luật. Công an thị xã khuyến cáo người dân, cơ quan, tổ chức trên địa bàn phản ánh, tố giác, cung cấp thông tin, tài liệu về các trường hợp có sai phạm trong hoạt động cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất để cơ quan điều tra làm rõ toàn bộ hành vi sai phạm có liên quan.