Phải tự hạch toán, tính đúng tính đủ để lấy thu bù chi nên học phí của các trường tự chủ tài chính khá cao và sẽ tăng lên theo lộ trình hàng năm. Tùy theo ngành học, mức học phí sẽ dao động từ 15 triệu đến gần 50 triệu đồng/năm/sinh viên.